苏计国

苏计国，燕山大学副教授。主要研究方向是蛋白质折叠机理及蛋白质结构-功能关系研究，为蛋白质功能改造及合理的药物设计提供理论基础。近年来，基于统计物理学理论，发展了一系列有效的简化模型和理论方法，成功应用于蛋白质折叠及蛋白质变构机制研究，深入探讨了蛋白质拓扑结构及其动力学特性与蛋白质折叠和蛋白质功能之间的内在关系。主要研究工作有：1．基于弹性网络模型，通过模拟计算和统计分析，揭示了蛋白质拓扑结构本身所固有的动力学特性对其去折叠过程的重要影响。在此基础上，根据统计物理学理论，发展了一种迭代的弹性网络方法，把蛋白质去折叠过程简化为一个缓慢升温下的准平衡过程，去折叠过程的每一步体系的熵增最大。所提出的理论方法能够很好地预测蛋白质去折叠过程。2．根据统计热力学理论，提出了一种热力学微扰方法，成功应用于蛋白质构象转变中关键残基的识别研究。该方法对蛋白质体系内的每一个残基进行微扰，能够显著改变蛋白质构象转变前后自由能差的残基认为是构象转变中的关键残基。所提出的方法理论严密、计算速度快，并且能够特异性地考虑同一蛋白质体系不同的变构过程。3. 基于弹性网络模型，提出了一种有效的热力学方法，识别蛋白质表面的变构位点，为基于结构的药物设计提供有价值的生物学信息。该方法通过计算蛋白质表面不同部位与活性位点之间的热力学耦合效应来识别变构位点，预测结果与实验能够很好的吻合。4. 把静电相互作用加入到Gō模型中，对传统的Gō模型进行了改进，开发了相关模拟程序包，利用所改进的模型很好地揭示了静电相互作用对冷休克蛋白热稳定性和折叠动力学的影响。5. 基于相对熵理论和氨基酸HNP模型，对课题组其他研究者所开发的蛋白质折叠和蛋白质设计程序包进行了改进和发展，进行了小蛋白的结构预测和序列设计研究，预测结果与实验能够很好的吻合。基于复杂网络模型，研究了蛋白质氨基酸网络的结构特征，通过网络拓扑参量的分析，研究了蛋白质拓扑结构对蛋白质折叠的影响。