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会议详情 |
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推荐会议：第六届“中医药临床验方立项研发与成果转化思路”专题研讨会
发票类型：增值税普通发票
参会凭证：邮件/短信发送参会通知
第11期单细胞测序数据挖掘与课题设计学习班
一周内教会您，每晚三个半小时、边学边消化，理论与实战相结合
2020年8月10-14日 （周末线上授课 非视频授课）
发表Nature等杂志四十多篇论文的中科院老师授课，
赠送视频供回放使用、建群做后续答疑、线下复听免费
【课程背景】
单细胞测序技术作为科研领域最新、最热的技术,发展神速。好的技术给科研带来了更为丰富、精准的数据。如何在最终的数据分析中结合生物学背景挖掘到更多信息也是困扰很多科研人员的一大难题。为了让更多的研究者了解单细胞测序数据挖掘的常用套路以及单细胞常用数据分析软件的使用特举办单细胞测序数据挖掘与课题设计学习班。
【学习目标】
1、了解单细胞测序基本概念及原理
2、了解单细胞测序分析的常用软件
3、掌握单细胞测序数据的下载方法
4、掌握单细胞测序数据的研究思路
5、学会R语言基本语法和绘图技巧
6、学会用R代码进行单细胞转录组分析并作图
7、熟悉CNS杂志单细胞转录组文章思路
8、熟悉零成本的单细胞相关课题设计思路
9、获得全套全自动化分析单细胞数据的流程脚本
【主办单位】
玮瑜科研平台（上海玮瑜生物科技有限公司）
【承办单位】
上海玮瑜生物科技有限公司
上海焦务科技服务中心
【会议时间】
2020年8月10-14日
玮瑜科研平台（上海玮瑜生物科技有限公司）
玮瑜科研平台（上海玮瑜生物科技有限公司）于2019年12月28日举办2019转录组测序数据分析及案例实践培训班（12月上海班）。
【课程设置】
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第一天晚上 7:00- 10:30 |
单细胞测序技术与应用 |
1. 单细胞组学技术发展历程和原理介绍。 2. 单细胞测序技术在科研领域的应用。 3. 近年单细胞技术CNS文章思路解析。 4. 单细胞文章常见图表解读。 5. 单细胞组学技术在癌症、发育、免疫及在植物等领域的研究内容及思路。 |
理论 |
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第二天晚上 7:00- 10:30 |
Linux及R语言入门与实操 |
1. 常规基础Linux命令入门讲解及实操训练。 2. R语言简介及安装，RStudio的安装及使用说明。 3. R语言语法介绍及常用命令。 4. 数据处理功能及统计应用。 5. R语言画图实操：tSNE，小提琴图，热图，网络图，GO、KEGG富集图，GSEA等图形绘制。 |
实操 |
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第三天晚上 7:00- 10:30 |
单细胞转录组数据分析思路及流程 |
1. 单细胞高分文章分析思路解析（细胞类群确定、拟时间分析、差异表达、通路富集、转录因子、配体受体互作等）。 2. 单细胞转录组比对、定量、分群及拟时间分析等软件及参数。 3. 单细胞转录组转录因子、功能通路及配体受体互作思路解析。 4. 单细胞组学分析常用数据库介绍及使用。 5. 基因富集分析和可视化。 |
理论 |
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第四天晚上 7:00- 10:30 |
单细胞数据可视化、细胞分型及marker鉴定 |
1. 10X官方单细胞软件Cellranger讲解及实操。 2. 从基因表达矩阵开始到marker基因筛选全过程讲解及实操。 3. 通过Seurat软件进行PCA及tSNE降维。 4. 单细胞转录组细胞鉴定及聚类分析。 5. 通过Seurat及GSVA等进行单细胞转录组差异分析。 |
实操 |
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第五天晚上 7:00- 10:30 |
单细胞数据轨迹分析，功能富集 |
1. 通过Monocle软件进行单细胞转录组拟时间分析。 2. 通过DAVID及metascape网站进行通路富集分析。 3. 单细胞数据分析总结。 4. 归纳总结零成本单细胞数据挖掘思路。 5. 单细胞测序基金申请思路、准备内容及注意事项等。 |
理论+ 实操 |
【授课专家】
来自中科院，长期从事单细胞多组学方面的项目研究，发表Nature等杂志四十多篇论文，目前承担国家科技部、国家自然基金委和重点研发计划等多项课题。
【注册费用】
2800元/人。
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2020-08-10 09:00 至 2020-08-14 17:00
40人