探索空间信息，单细胞空间转录组学（Spatial Transcriptomics）实战

-会议内容-

探索空间信息，单细胞空间转录组学（Spatial Transcriptomics）实战

2021/9/4-5  网络精讲班（会议时间两天&一晚）

莫速乎科研会议平台主办 

课程背景

近年来单细胞转录组测序技术的应用拓宽了人们的视野，使科学家们能够深入了解组织中基因表达状态、细胞的构成的多样性尤其是肿瘤组织的异质性。然而使用单细胞测序的组织必须通过机械分离或酶解消化成单细胞悬液，此过程不可避免的丢失了组织中细胞所处的原始位置信息，也导致了细胞间的通讯网络被打破，这使我们难以获得组织中不同区域的细胞构成和基因表达状态，以及不同功能区之间的基因差异表达等信息。

      空间转录组的出现极大地解决了这个问题，运用这项技术，我们可以完整地获得感兴趣区域的基因表达情况以及空间分布差异。由于单细胞空间转录组学技术在揭示组织中细胞的空间信息方面的重要作用，Nature Methods 将“空间转录组技术”被评为 2020 年年度技术方法。

      单细胞转录组测序技术解决了细胞通量和分辨率的问题。而空间转录组技术（spatial transcriptomics）则还原了细胞空间位置和基因表达的空间异质性。

     如果说单细胞技术是热门，那空间转录组就是蓄势待发的黑马 ，以(Spatial Transcriptomics[Title/Abstract]) 为关键词在 pubmed 中检索，目前共有 175 篇文章，其中IF 5-10 分 39篇，10-20分 30 篇，20 分以上 38 篇，随着测序技术的不断普及，空间转录组无疑是接替单细胞转录组的高分文章的下一个蓝海，单细胞技术和空间转录组二者的结合，可以碰撞出不一样的火花，能大幅度提升文章的质量和分数。

      然而空间转录组动辄几十万的费用让很多研究人员望而却步，那么有没有可能去挖掘别人的数据不花一分钱来为自己的课题舔砖加瓦甚至是再挖掘出一篇新的文章呢？当然有！

      莫速乎教育邀请到国内领先数据可视化团队的 Dr. Xi 为大家专门设计了一门结合单细胞和空间转录组的高级课程，以高分文章（30+）的流程为指导，从 R 语言以及生物信息学基础入手到如何挖掘单细胞以及空间转录组信息并且形成科研思路，抽丝剥茧进行详细地讲解和实战，提供全部流程的代码和数据可视化经验，不仅如此，Dr. Xi 将会结合自己的学习路径，将如何不断学习的方法全盘托出，真正做到授人以渔，一次学习， 终生受益！

课程目标

1、掌握R 语言基本操作，如何快速处理报错2、了解单细胞测序及空间转录组基本概念及测序原理3、掌握生物信息学常见概念及原理4、掌握单细胞及空间转录组分析5、如何将单细胞数据与空间转录组数据结合6、熟悉单细胞及空间转录组的发文思路，如何用好单细胞及空间转录组数据

课程亮点

1、全新的空间转录组分析教程，用代码实现全套分析；2、结合高分文章(IF 30+)的算法，打通单细胞测序和空间转录组的界限。

主讲人

     Dr.Xi, 临床医生，专注于数据挖掘及可视化，国内领先数据可视化团队核心成员。拥有大量单细胞及空间转录组数据挖掘经验。发表SCI 论文 10 余篇，Dr. Xi 深知临床医生及研究生无经费和课题之苦，将结合自身的学习经验探讨临床医生及研究生最佳的成长路径，授人以鱼更要授人以渔！

适合人群

广大临床/科研工作者，研究生，零基础同样可以参加（R 语言如何入门到精通）。

-主办方介绍-

上海莫速乎教育投资有限公司

莫速乎科研教育，简称莫速乎，原名“多圈课堂”，创立于2012年12月，隶属于上海莫速乎教育投资有限公司。2014年3月更名为“莫速乎科研教育”，品牌名源于我国古代著名教育家《荀子·劝学》“学之经 莫速乎”。莫速乎旨在通过独创的EAT理念打造最易接收并最能提高实际技能的高清视频课程，以作为科研传统教育的补充或替代。同时将持续开展现场研讨班，以弥补视频课程之不足。EAT理念以荀子思想为根基，并从“学”的角度优化教学，且课程策划符合哲学的认识论规律，是目前“最符合人性”的教学理念。在课程策划方面，我们坚信每个小领域只需要一部课程，一部优秀的课程，经典的课程，足可供全国千百万人学习，莫速乎正是立志于打造每个小领域内的这一部课程。

莫速乎科研教育（上海莫速乎教育投资有限公司）

莫速乎科研教育，简称莫速乎，原名“多圈课堂”，创立于2012年12月，隶属于上海莫速乎教育投资有限公司。2014年3月更名为“莫速乎科研教育”，品牌名源于我国古代著名教育家《荀子·劝学》“学之经 莫速乎”。莫速乎旨在通过独创的EAT理念打造最易接收并最能提高实际技能的高清视频课程，以作为科研传统教育的补充或替代。同时将持续开展现场研讨班，以弥补视频课程之不足。EAT理念以荀子思想为根基，并从“学”的角度优化教学，且课程策划符合哲学的认识论规律，是目前“最符合人性”的教学理念。在课程策划方面，我们坚信每个小领域只需要一部课程，一部优秀的课程，经典的课程，足可供全国千百万人学习，莫速乎正是立志于打造每个小领域内的这一部课程。