DNA及RNA甲基化数据分析、课题设计与基金写作学习班

第一天上午

8:30-

11:30

DNA甲基化调控机制、科研应用及研究思路

1. 明确DNA甲基化的作用机制及调控机理。

2. 了解DNA甲基化在疾病等各研究领域中的应用。

3. 了解DNA甲基化与转录组等多组学整合分析思路。

4. 通过高分文章对DNA甲基化研究思路进行解读。

5. 掌握DNA甲基化研究的多种技术方法。

6.  了解常用DNA甲基化及疾病挖掘数据库。

理论

第一天下午

1:30-

17:00

DNA甲基化芯片及测序数据分析

1. DNA甲基化芯片及测序分析常用软件介绍。

2. DNA甲基化芯片及测序数据分析策略。

3. DNA甲基化芯片及测序分析图表解读。

4. 差异甲基化鉴定、注释及富集分析。

5. DNA甲基化芯片数据分析 （ChAMP等软件）。

6. DNA甲基化测序数据分析（bismark，methylKit等软件）。

7. DNA甲基化与转录组数据整合分析。

8. 利用公共甲基化数据完成整套甲基化分析流程。

实操

第一天晚上

18:00-21:00

RNA甲基化功能机制、研究策略及思路分析

1. RNA甲基化研究进展概述。

2. 了解RNA甲基化的概念和修饰类型。

3. 明确RNA甲基化对RNA加工代谢及生物学功能的调控机制。

4. 了解RNA甲基化在疾病等领域中的研究应用。

5. 通过高分文献思路示例及总结对RNA甲基化调控肿瘤等功能研究思路进行解析。

6. 了解RNA甲基化常用的各种测序技术。

7. m⁶A甲基化的研究现状、思路和研究方法。

理论

第二天上午

8:30-

11:30

m⁶A甲基化数据分析

1. 了解各种RNA甲基化修饰谱分析技术。

2. m⁶A测序技术流程介绍及测序报告解读。

3. m⁶A常见分析内容及相关软件介绍。

4. m⁶A peak鉴定(R包exomePeak、MACS2)、peak差异分析(R包exomePeak)、motif分析（Homer、MEME）及peak分布（RMBase）等。

5. m⁶A修饰基因的功能富集分析（DAVID，Metascape、GSEA等）。

6. 预测m⁶A甲基化位点在线工具介绍。

7. m⁶A常用数据库介绍及使用（MeT-DB，m6AVar，RMBase）

实操

第二天下午

1:30-

17:00

m⁶A甲基化多组学整合分析，课题设计与基金申请

1.  m⁶A甲基化测序的项目延伸及思路拓展。

2.  m⁶A甲基化与多组学数据（RNA-seq，Ribo-seq等）整合分析。

3. 非编码RNA（miRNA及lncRNA等）的m⁶A甲基化分析。

4. 通过TGGA、ICGC等数据库挖掘RNA甲基化癌症研究思路。

5.  RNA甲基化研究策略与课题设计 。

6.  RNA甲基化研究经验交流。

7.  RNA甲基化相关国自然课题的介绍。

8.  DNA及RNA甲基化基金申请思路、准备内容及方案设计注意事项等。

9.  讨论及个性化问题答疑。

理论+实操