山东-青岛多组学联合网络药理学、分子对接及实验验证

-会议内容-

【会议简介】

本次学习班课程将结合《网络药理学评价方法指南》，以最简单易懂的方式介绍复杂疾病和中药复方研究所用到的网络生物学的数据、方法和技术，并以中药复方解析的工作流程为线索，讲授如何一步一步地研究复杂疾病和挖掘中药复方的作用机制。课程内容全面覆盖网络药理学的数据获取、数据分析和可视化、验证实验设计、论文撰写、课题设计、基金申请等内容。本学习班全部采用免费数据库和在线分析工具，学员不需要编写程序。

*本次学习班全程电脑实战教学，90%以上为上机指导操作，无繁琐的理论授课，做到课程学完，就能独立分析中药复方。老师将长期在学习群解答学员问题。

【会议时间】

2023年4月26日上午9:00—12:00 ；下午14:00—17:00

2023年4月27日上午9:00—12:00 ；下午14:00—17:00

2023年4月28日上午9:00—12:00 ；下午14:00—17:00

【参会方式】

线下授课，山东青岛

【会议大纲】

网络药理学基础知识和数据获取

（一）网络药理学基础知识

1. 网络药理学的发展历程和经典文献介绍

2. 分析网络药理学SCI论文3篇，解析数据分析要点和论文写作模式

3. 网络药理学的核心问题和研究流程

（二）网络药理学数据获取

   1. 中药有效成分以及对应靶点的查找和获取。

（1） 使用中药数据库获取中药有效成分、进行ADME筛选、获取化合物的靶标

（2） 用化合物信息数据库获取中药小分子的结构、ADME信息、靶标

（3） 用蛋白质信息数据库进行靶蛋白的名称、ID转换

（4） 用化学相似性预测化合物靶点

（5） 基于药效团模型的药靶预测

（6） 用QSAR模型预测化合物靶标

2. 中药治疗疾病相关基因的获取

（1） 在OMIM, DisGeNet，Genecards查找和获取中药所治疗疾病的相关基因

（2） 使用西药数据库获取治疗某种疾病的西药和对应靶标

（3） GEO数据库中获取疾病相关基因芯片数据并进行差异表达分析

 网络药理学的数据分析和可视化

1. 分子对接： 

（1）PyMol软件介绍

l 蛋白对象的操作、展现、隐藏、标记、测量

l 分子对接结果的美化展示

l 配体-受体结合位点可视化分析工具介绍

(2）用AutoDock Vina软件进行分子对接,包括一对一对接和多对多对接

2. 组学数据及中药靶点的功能富集分析（包括基因、代谢物、以及基因-代谢物的联合功能富集分析等）

3. 基于基因表达谱数据用CMAP分析药物作用机制

4. 基因关联网络、基因共表达网络的构建

网络药理学数据分析、验证实验设计、研究案例、课题设计

1.Cytoscape软件的详细讲解：网络构建、分析、美化 

（1） 靶标网络、疾病网络构建和分析

（2） 药物-靶标相互作用网络构建和分析

（3） 药物-靶标-通路网络的构建和分析

（4） 代谢物网络的构建与分析，基因-代谢物关联网络的构建,代谢组与转录组/蛋白组/网络药理学联合分析

（5） 网络拓扑特征的计算；网络拓扑指标的含义；重要节点识别；模块分解；网络可视化和美化；Cytoscape插件的安装和使用等

2. 网络药理学常用图形绘制

维恩图、通路富集图等的绘制

3. 网络药理学验证实验设计

4. 网络药理学相关学术期刊介绍

5. 网络药理学SCI论文写作和高分文章解析

6.《网络药理学评价方法指南》解读

7. 网络药理学相关的项目设计解析

【参会费用】

1.参会费用：3980/人。可开具报销发票及会议通知。

2.团体5人以上报名，可免费赠送一个名额

*备注：实际授课时还会增加一些报名学员反馈的针对性问题。另外自备笔记本电脑，安装WINDOWS 10操作系统及Office Excel 2010等软件。

-主办方介绍-