会议详情 |
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非编码RNA与外泌体研究策略及数据分析实战研讨会
2021年5月15-20日 腾讯会议网络会议室
会议背景:
非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)研究是当今生命科学领域发展最迅速的前沿领域之一。非编码RNA在生命调控过程中扮演着重要角色,近年来的研究成果经常入选CNS年度十大科学突破。目前在高等生物中,存在着一个巨大的、尚未被完全发现的RNA世界。人类基因组转录区高达76%,但转录产物中只有不到2%是编码蛋白质的mRNA,其他都是非编码RNA,其中microRNA (miRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)、环状RNA(circular RNA,circRNA)等调控性ncRNA因其重要的调控功能,受到科学家们广泛关注。近年来,非编码RNA一直是生命科学领域的研究热点,也是国家自然科学基金等鼓励申报的重要领域。该研究将从全新的角度揭示生命调控的分子机制,并为人类疾病的诊断和防治提供理论依据和新的技术。
Exosomes可以由多种细胞类型(免疫细胞、心血管细胞、神经细胞、干细胞、肿瘤细胞)释放,因此,exosomes也会参与多种生理或病理过程,如抗原呈递、RNA转运、组织修复、神经退行性疾病、肿瘤转移、代谢重建等。Exosome中含有细胞特异的蛋白、脂质和核酸,能作为信号分子传递给其他细胞从而改变其他细胞的功能。Exosome在体内存在的广泛性和获取的便捷性,已经成为了疾病诊断治疗的潜在有效方式,在精准医学发展上有着光明的前景。开展本次研讨会的目标是为了让刚接触外泌体领域的年轻科研人员能掌握尽快上手做这方面的研究方法,为一些已经在外泌体研究中碰到问题的研究者解决实际科研问题。
适合人群:
从事医学、动物、植物学等生物学方向的科研工作者。无需有工具操作和编程语言基础。
会议预期:
1、了解非编码非编码RNA与外泌体研究的研究策略、研究方法,以及相关课题设计的思路和要点
2、掌握非编码RNA相关数据库/工具的使用、分析思路和实用操作知识点,设计贴合自身研究课题的方案。
非编码RNA与外泌体研究策略及数据分析实战研讨会日程 |
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理论部分(2个白天) |
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时间安排 |
大纲 |
详细内容 |
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第一天 |
9:00-10:30 |
调控性非编码RNA简介 |
调控性非编码RNA概念及重要分类; 调控性非编码RNA的来源与生成机制。 |
10:30-10:45 |
茶歇 |
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10:45-12:00 |
调控模式及研究意义 |
调控性非编码RNA的调控模式; 调控性非编码RNA研究意义。 |
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12:00-13:30 |
午饭及午休 |
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13:30-15:00 |
调控性非编码RNA常用研究技术(一) |
表达谱芯片与RNA-seq数据分析 实时定量PCR; Northern Blot; 原位杂交; Knock down和Over-expression。 |
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15:00-15:20 |
茶歇 |
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15:20-17:30 |
调控性非编码RNA常用研究技术(二) |
RNA-RNA、RNA-DNA、RNA-蛋白质等相互作用研究技术; 报告基因分析、ChIRP、RIP、RNA pull-down; 转录调控技术:ChIP、EMSA、Oligo pull-down、Run on、Run off。 |
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第二天 |
9:00-10:30 |
调控性非编码RNA相关数据库介绍(一) |
microRNA:miRbase、targetscan、mirtarbase、RNAhybrid等。 |
10:30-10:45 |
茶歇 |
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10:45-12:00 |
调控性非编码RNA相关数据库介绍(二) |
lncRNA:rbpdb、lncRNAdb、LNCipedia等 ; circRNA:circBase、CircInteractome、circRNADb等。 |
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12:00-13:30 |
午饭及午休 |
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13:30-15:00 |
外泌体与调控性非编码RNA |
外泌体概述 外泌体分离方法; 外泌体检测方法; 外泌体常用数据库; 外泌体与miRNA、lncRNA、circRNA研究案例分析。 |
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15:00-15:20 |
茶歇 |
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15:20-17:30 |
解读标书及答疑 |
解读并分享6份近三年非编码RNA(lncRNA,circRNA,外泌体)相关国自然标书; 现场答疑。 |
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注意:理论部分为非编码RNA与外泌体研究策略、研究方法的详细讲解,可现场与讲师沟通课题思路等问题,但不涉及数据分析实操。 |
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实操部分(四个晚上) |
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时间安排 |
大纲 |
详细内容 |
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第一晚 |
19:00-20:20 |
基础简介 |
生物信息介绍 非编码RNA的机制、调控模式(miRNA、lncRNA与circRNA) 非编码RNA的创新文献解读(含miRNA、lncRNA和circRNA) |
20:30-20:45 |
茶歇 |
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20:45-22:00 |
数据库简介 |
NCBI GEO数据库解读 miRNA 注释数据库(注释及序列下载) lncRNA注释数据库(注释及名称转换) circRNA注释数据库 |
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第二晚 |
19:00-20:20 |
miRNA分析 |
miRNA-seq高通量测序解读 差异miRNA分析 miRNA-mRNA数据库(验证和预测结果) miRNA与靶基因结合位点(MRE)分析 VENN图分析 癌症的miRNA预后分析 |
20:30-20:45 |
茶歇 |
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20:45-22:00 |
lncRNA分析 |
lncRNA-seq高通量测序解读 miRNA-lncRNA数据库 lncRNA-target分析 lncRNA参与的ceRNA分析 |
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第三晚 |
19:00-20:20 |
circRNA分析 |
circRNA-seq高通量测序解读 miRNA-circRNA数据库 circRNA参与ceRNA的分析 |
20:30-20:45 |
茶歇 |
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20:45-22:00 |
ceRNA分析 |
ceRNA(竞争性内源RNA)的机制 ceRNA关系对分析 ceRNA网络构建 |
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第四晚 |
19:00-20:20 |
功能富集分析 |
lncRNA-mRNA共表达分析 miRNA功能分析(GO和pathway富集) lncRNA功能分析(GO和pathway富集) circRNA功能分析(GO和pathway富集) |
20:30-20:45 |
茶歇 |
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20:45-22:00 |
研究思路 |
miRNA高通量数据分析的创新思路 lncRNA高通量数据分析的常见思路 circRNA高通量数据分析的常见思路 |
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注意:实操部分课程涉及课题设计思路讲解和大量软件实操。上课使用软件为Cytoscape和GSEA。 |
讲师简介:
理论部分:孙教授,学科带头人,硕士生导师,专注于非编码RNA研究十余年,长期活跃于科研一线,熟悉非编码RNA的研究现状和研究策略,具有扎实的理论基础和丰富的实验技能。主持承担10余项miRNA、lncRNA和circRNA等ncRNA相关科研项目(包括2项国家自然科学基金);发表学术论文20多篇,单篇最高他引110多次(年均他引20余次)。
实操部分:交大生物信息学博士,参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。
讲课经历:在上海、沈阳、济南、武汉等城市举办过十几场培训班。培训的对象有:医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。
会议时间:2021年5月15-20日 15-16两天为研究策略理论课,17-20四晚为数据分析实操课
会议地点:线上:腾讯会议网络会议室
主办方:上海遐永医药科技有限公司
收费标准:
会务费:
理论部分 2800元/人
实操部分 2800元/人
可单独只参加一部分的学习,同一人两部分都学习则会务费为4600元/人
优惠政策:
1. 提前确认报名及转账的,可以提前拿到学习材料
2. 三人组团报名,每人优惠100元
3. 四人组团报名,每人优惠200元,
4. 五人组团报名缴费,额外带一人免费注册!
可以开正规会务发票,纸质邀请函(盖红章)。
注意事项:携带携带电脑,最好是windows系统
上课所用软件为Cytoscape、GSEA。软件安装包可提前向主办方会务组索要
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