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“DNA元件百科全书”计划(encyclopedia of DNA elements,简称ENCODE)是继“人类基因组计划”后又一大型国际合作项目。来自世界各国32个研究机构的442名科学家历时5年,解读生命体的功能元件,发现人类基因组看似多余的“垃圾序列”至少80%是有功能的,其中包括了大量的非编码RNA和转座子。
第一届国际表观基因组学研讨会
而由美国NIH资助的表观组学线图计划(Roadmap Epigenomics Mapping Consortium,简称Roadmap),致力于绘制人类表观组学图谱,深度探究DNA甲基化修饰在遗传、发育、疾病中的作用。 毫无疑问,这两大数据宝库为人类发育和疾病发生研究以及精准医学治疗提供了大量公开而可靠的数据资源。但应当如何解读和应用这些重要的科研成果?
为此,复旦大学发育与遗传协同创新中心拟于2015年10月19日至20日在复旦大学邯郸校区举办第一届国际表观基因组学研讨会(The 1st International Epigenomics conference, Shanghai),我们邀请了国内外ENCODE和Roadmap计划核心参与者以及相关领域的著名专家学者为参会者解读ENCODE和Roadmap计划的重要研究成果,从而促进大型国际国内学术交流与合作,推动基础生物学和转化医学研究进程。
组织结构
主办单位:遗传与发育协同创新中心、遗传工程国家重点实验室
时间:2015年10月19-20日
地点:上海
10月18日,星期日
16:00—20:00 注册与签到
10月19日,星期一ENCODE专场
07:00--08:00 早餐
08:00--08:15 开幕式
08:15--08:30 合影
08:30--09:20 陈润生, 中科院生物物理研究所, 中国
(报告题目: )
9:20--09:45 Ross Hardison, 宾夕法尼亚州立大学, 美国
(报告题目: )
09:45--10:00 茶歇
10:00--10:50 Bing Ren, 加州大学圣迭亚哥分校,美国
(报告题目: )
10:50--11:15 Feng Yue,宾夕法尼亚州立大学,美国
(报告题目: )
11:15--11:40 Tom Gingeras, 冷泉港实验室,美国
(报告题目: )
11:40--12:05 屈良鹄, 中山大学,中国
(报告题目: )
12:05--13:30 午餐
13:30--13:55 韩敬东,中科院上海计算生物学研究所,中国
(报告题目: )
13:55--14:20 杨力, 中科院上海计算生物学研究所,中国
(报告题目: )
14:20--14:45 Yijun Ruan ,The Jackson Laboratory,USA
14:45--15:00 茶歇
15:00--17:30 Feng Yue, Encode 专题讨论会
Navigate ENCODE data:
Learn to use resources for viewing, querying, and downloading ENCODE data
Analyze ENCODE data:
Learn to use ENCODE web-based and command-line analysis tools
Run ENCODE processing pipelines on your own data (ChIP-seq, RNA-seq, DNase-seq, DNA methylation)
Use ENCODE data to:
Interpret human variation and personal genomes
Interpret cancer genomes
Identify likely cell types and pathways underlying non-coding disease associations
Integrate ENCODE data with those from your lab or major projects (e.g., Roadmap Epigenomics, IHEC, TCGA, etc.)
18:00--20:00 欢迎晚宴
10月20日,星期二Epigenome专场
07:00--08:30 早餐
08:30--08:55 Martin Hirst, 英属哥伦比亚大学, 加拿大
(报告题目: )
08:55--09:20 刘江,中科院北京基因组研究所,中国
(报告题目: The inheritance and programming of parental DNA methylome in animals )
09:20--09:45 张勇, 同济大学,中国
(报告题目: )
09:45--10:00 茶歇
10:00--10:50 John Stamatoyannopoulos, 华盛顿大学,美国
(报告题目: )
10:50--11:15 Ting Wang, 华盛顿大学-圣路易斯, 美国
(报告题目: )
11:15--11:40 于文强, 复旦大学生物医学研究院,中国
(报告题目: DNA Methylation,Challenge and Chance )
11:40--12:05 Jason Ernst, 加州大学洛杉矶分校, 美国
(报告题目: )
12:05--13:30 午餐
13:30--13:55 Hillary Sussman, Genome Research执行编辑, 美国
(报告题目: )
13:55--14:20 石乐明 ,复旦大学药学院, 中国
(报告题目: )
14:20--14:45 鲁先平,深圳微芯生物科技有限公司,中国
(报告题目: )
14:45--15:00 茶歇
15:00--17:30 Ting Wang, Roadmap Epigenome专题讨论会The NIH Roadmap Epigenomics Project and Engaging current epigenomic resources
Overview of the supplementary website of the Roadmap Epigenomics project
Analysis and visualization of hundreds of epigenomes,
Epigenomic annotation of genetic variants and tutorial of the WashU Epigenome Browser
18:00--20:00 晚餐
参会代表注册费按人民币1000元/人(其中博士后和学生按人民币800元/人)收取;
注册费包括会议组织费、餐费、会议场地费等。参会人员住宿和路费自理。
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