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生物信息数据处理与Perl语言编程应用专题培训班

生物信息数据处理与Perl语言编程应用专题培训班

2018-01-17 08:00 至 2018-01-19 18:00

北京   北科产业3号楼

中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会   

报名截止

推荐会议:2019第三届生物治疗国际学术会议

发票类型:增值税普通发票 增值税专用发票

-会议内容-

Perl语言作为绝大多数生物信息学工作者首选语言之一。北京市计算中心生物计算事业部针对没有任何计算机语言的生物学、医学、农学等人员,且有从事生物信息学工作相关研究工作的需要。欢迎您报名参加!

主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会 
承办单位:北京市计算中心 
协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室 
          中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会 
          北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心 
          中国生物工程杂志 
          北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司 

          北京微生太科技有限公司

举办地:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
培训时间2018.1.17-19(报名中)上午9:30-12:00,下午13:30-17:00


培训特色
1、对口生物信息;    2、非严格语法,适合初学;
3、功能强大、跨平台;4、有巨大的第三方代码库CPAN

-主办方介绍-

中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会 中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会

中国生物工程学会(Chinese Society of Biotechnology,CSBT)成立于1993年,首任理事长:谈家桢院士,现任理事长:高福院士。中国生物工程学会成立以来,主办、承办、协办了多个国际、国内学术交流活动,为促进生物技术与生物产业发展、提高国民素质、促进经济和社会发展等方面发挥了重要作用。

日期

授课题目

授课内容

第一天

概述

1.    生物信息学数据处理概述;

2.    Perl语言简介特点与数据处理的优势与应用范围

运行调试

3.    Perl语言解释器、编辑器安装;

4.    Perl运行环境测试与程序编写;

5.    UltraEdit软件应用与生物信息学数据文件处理;

6.    基于宏的perl语言快速编程

操作基础

7.    Perl语言基本变量、操作符、判断结构;循环结构;

8.    Perl语言常用函数的功能应用;

9.    生物学数据文件的读入与输出;

10.  生物信息学常见文件的分割、合并、过滤、信息提取等;

11.  批量自动化数据文件操作

第二天

生物信息实例应用

12.  常用生物信息学数据文件格式简介;

13.  用perl从NCBI、ENA等数据库批量下载基因序列;

14.  用perl进行生物学数据文件格式转化;

15.  用perl编程从Fasta、GBK、Fastq、PDB等提取关键生物学数据信息;

16.  用perl批量自动化下载基因序列;

17.  用perl进行DNA到protein批量翻译

18.  用perl批量DNA序列反向互补;

高级数据处理

19.  Perl语言的数组、二维数组、hash表用法;

20.  用perl自动化从表格数据提取信息;

21.  矩阵数据文件的生成与应用

22.  二代测序NGS、GWAS等生物信息分析中perl的应用

第三天

模块与子程序

23.  perl子程序与模块应用;

24.  强大的正则表达式的应用;

25.  用perl进行基因ID列表比较、筛选与统计;

Perl的高级应用

26.  Perl第三方代码库CPAN的简介与应用;

27.  Bioperl模块与应用;

28.  常用生物信息学程序实例;

29.  用perl进行批量自动化本地blast比对及数据分析;

30.  基于perl的circos基因组作图工具介绍;

(此表仅供参考,授课内容以实际授课为准)

-会议门票-

【报名费用】 注册费3800元/人,含听课费、材料费、上机费和午餐。请自带笔记本电脑用以上机实习。材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社

报名优惠政策
1、12.20日前报名缴费,可享受减免200元优惠;
2、3人以上团体报名每人可减少400元;
3、4+1团报,可免费赠送一个名额                
4、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

-场馆介绍-

北科产业3号楼 北科产业3号楼

北京中关村永丰高新技术产业基地位于海淀区北清路99号。按不同的用地性质规划为4个工业生产区、一个公共服务中心和一个生活居住区。规划建筑面积386.85万平方米,规划绿地率35%,总容积率0.99。基地内科研、工业区用地207.16公顷,重点吸纳新材料产业、信息产业、生物工程与新医药产业、环保及资源综合利用产业、光机电一体化产业、空间技术产业等经济效益好、科技附加值高、技术密集的绿色环保无污染的高新技术产业。科研、工业1区位于基地西北部,用地面积82.68公顷,划分为77个地块,计划发展成为以纳米材料技术产业、超导材料技术产业、砷化镓和镁合金技术产业为主导的新材料产业园区。

会议标签:

生物治疗

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