发nature、nature cell biology杂志10多篇文章的老师一周内教您学会挖掘单细胞测序公共数据库来发表文章

第一天晚上

7:00-

10:30

单细胞测序技术与应用

1. 单细胞组学技术发展历程和原理介绍

2. 单细胞测序技术在科研领域的应用

3. 近年单细胞技术CNS文章思路解析

4. 单细胞文章常见图表解读

5. 单细胞组学技术在癌症、发育、免疫及在植物等领域的研究内容及思路

理论

第二天晚上

7:00-

10:30

Linux及R语言入门与实操

1. 常规基础Linux命令入门讲解及实操训练

2. R语言简介及安装，RStudio的安装及使用说明。

3. R语言语法介绍及常用命令

4. 数据处理功能及统计应用

5. R语言画图实操：tSNE，小提琴图，热图，网络图，GO、KEGG富集图，GSEA等图形绘制

实操

第三天晚上

7:00-

10:30

单细胞转录组数据分析思路及流程

1. 单细胞高分文章分析思路解析（细胞类群确定、拟时间分析、差异表达、通路富集、转录因子、配体受体互作等）

2. 单细胞转录组比对、定量、分群及拟时间分析等软件及参数

3. 单细胞转录组转录因子、功能通路及配体受体互作思路解析

4. 单细胞组学分析常用数据库介绍及使用。

5. 基因富集分析和可视化

理论

第四天晚上

7:00-

10:30

单细胞数据可视化、细胞分型及marker鉴定

1. 10X官方单细胞软件Cellranger讲解及实操

2. 从基因表达矩阵开始到marker基因筛选全过程讲解及实操

3. 通过Seurat软件进行PCA及tSNE降维

4. 单细胞转录组细胞鉴定及聚类分析

5. 通过Seurat及GSVA等进行单细胞转录组差异分析

实操

第五天晚上

7:00-

10:30

单细胞数据轨迹分析，功能富集

单细胞基金写作

1. 通过Monocle软件进行单细胞转录组拟时间分析

2. 通过DAVID及metascape网站进行通路富集分析

3. 单细胞数据分析总结

4. 归纳总结零成本单细胞数据挖掘思路

5. 单细胞测序基金申请思路

6. 单细胞测序基金申请前期准备

7. 单细胞测序基金申报常见问题分析与应对

8. 如何撰写单细胞基金课题申请书

理论+

实操