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生物信息学软件与工具使用培训班

生物信息学软件与工具使用培训班

2018-04-16 09:30 至 2018-04-19 17:00

北京   北京市计算中心

中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会   

报名截止

推荐会议:2024年中国地理学会世界政治经济地理大会

发票类型:增值税普通发票 增值税专用发票

-会议内容-

“工欲善其事,必先利其器”,对于从事生物信息学研究,软件和工具绝对是必不可少的。您对生物信息学常用的软件和工具可能进行过简单的了解和使用,但您可能在使用的过程中会遇到各种各样的疑问,如面对众多的生物信息学分析软件却不知该如何选择应用?对于软件繁杂的使用方法和众多参数不知如何取舍?为了解决您遇到的困扰,打开您的思绪,北京市计算中心生物计算事业部举办《生物信息学软件与工具使用培训班》。介绍生物信息学研究及数据分析中所用的各种数据库使用,通过实际项目演练,学习常用分析软件的使用方法,将课程各项知识点融会贯通,从而使学员深刻理解并掌握生物信息学数据库和工具使用的要点。大家赶快一起来交流探讨吧!一流的学员和经验丰富的老师在这里等着你的到来!

授课对象: 全国生命科学、基础医学、农林科学等领域大专院校、科研机构、公司企业从事分子生物学、生物化学、遗传学、基因组学等研究、开发和教学的第一线研发人员和青年教师、博士后和研究生。

主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会

承办单位:北京市计算中心

协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室

中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

中国生物工程杂志

北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司

北京微生太科技有限公司

北京依托华茂生物科技有限公司
培训地点:北京海淀区丰贤中路7号3号楼,北京市计算中心三层会议室

本次课程时间: 2018.4.16-19 上午:9:30 - 12:00  下午:1:30 – 5:00

-主办方介绍-

中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会 中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会

中国生物工程学会(Chinese Society of Biotechnology,CSBT)成立于1993年,首任理事长:谈家桢院士,现任理事长:高福院士。中国生物工程学会成立以来,主办、承办、协办了多个国际、国内学术交流活动,为促进生物技术与生物产业发展、提高国民素质、促进经济和社会发展等方面发挥了重要作用。

日期

时间

课程名称

课程内容

第一天

上午

09:30-

10:30

生物信息学概述与前沿

1. 基因组学与生物信息学背景知识介绍

2. 生物信息进展与前沿技术介绍

10:30-12:00

NCBI数据库

 NCBI数据库介绍:PubMed、Nucleotide(GenBank)、Genome、Structures(MMDB)、Taxonomy、UniGene、Entrez等,数据查询检索

第一天

下午

13:30-15:00

NCBI数据库

2. NCBI数据库数据上传提交与批量下载

3. NCBI数据库实例讲解与练习

15:00-17:00

Blast与序列比对

1. Blast与序列检索比对及参数

2. Blast建库与Blast本地化

3. 实例讲解与练习

第二天

上午

09:30-12:00

MEGA软件与分子进化

1. 分子进化理论基础

2. MEGA与系统发育树构建

3. 实例讲解与练习

第二天

下午

13:30-17:00

分子网络与生物学通路分析

1. 分子相互作用数据库与通路概述(Uniprot,String,DIP数据库)

2. 分子网络分析工具Cytoscape及插件使用

3. 实例讲解与练习

第三天

上午

09:30-12:00

基因组注释

1. 基因本体数据库GO及GO注释

2. 生物学通路KEGG注释方法与实现

3. David与基因注释

4. IPA简介,查询搜索,通路分析与网络构建

第三天

下午

13:30-15:30

疾病和基因突变数据库

1. GeneCard数据库介绍及使用

2. HGMD(人类基因突变数据库)数据库介绍及使用

15:30-17:00

药物基因组数据库

1. PharmGKB数据库介绍及使用

2. PGMD数据库介绍及使用

第四天

上午

09:30-12:00

表观遗传学

1. Encode数据库介绍及使用

2. Roadmap数据库介绍及使用

3. RegulomeDB数据库介绍及使用

第四天

下午

13:30-15:30

蛋白质3D结构

1. 蛋白质结构分析概述

2. PDB数据库介绍与使用

3. PyMol蛋白质结构分析软件介绍与使用

15:30-17:00

SPSS软件与生物统计应用

1. 生物统计概述

2. SPSS使用与生物统计应用

3. 实例讲解与练习

(课程内容以实际授课为准)

-会议门票-

报名费用培训费4000元/人,含听课费、资料费、上机费,请自带笔记本电脑用以上机实习。材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社;近最近酒店为:如家酒店(永丰店),可自行网上预定,食宿自理。报名优惠政策

1、3.20日前报名并缴费可优惠200元; 
2、3人以上团体报名每人可减少300元;

3、4+1团报,可免费赠送一个名额;

以上优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。

以收到学员培训费为成功报名,座位按收到费用先后顺序安排。

-场馆介绍-

北京市计算中心 北京市计算中心

北京市计算中心建立于一九七三年,是国内最早一批计算中心之一,是中国最早、最具影响力的从事计算机应用技术研究及推广的机构,服务对象则涉及工业、商业、交通、能源、环保金融、税务、社会事务等多个领域。北京市计算中心自成立以来,完成了上百项国家和北京市政府有关部门委托的研究项目和面向多种用户的服务型项目。先后获得国家及省部级成果奖30多项、,拥有了200余项国际国内领先的技术和产品,为中国计算机的普及、应用和发展做出了杰出贡献

会议标签:

生物信息学

温馨提示
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