基于生物信息学与网络药理学的复杂疾病病理及中药药理学研究技术研讨会

-会议内容-

中药网络药理学研讨会

——基于生物信息学与网络药理学的复杂疾病病理及中药药理学研究技术研讨会

往期学员评价很高，发课程视频（加密绑定仅供学员课后复习确保效果），建群会后持续讨论

2018/03/24-25(23日报到) 上海丰鑫国际大酒店

 

课程简介：

大多数复杂慢性疾病如心血管病、免疫系统病、癌症等都是多基因疾病，其疾病机理及治疗方法的研究一直是医学热点问题。近年来国际上倾向于用多靶点药物治疗复杂疾病，中药复方因其多成分、多靶点的特点在国际医学界及药物发现领域获得了较高的关注,成为中药现代化的重要机遇。国家在中药研究方面也有很大力度的投入和支持，中药复方的研究已成为近年来研究的热点和国家自然基金重点扶持的领域。然而，由多种天然产物配伍而成的中药复方，存在成分复杂、靶点和机制不清的问题，其研究难度很大，尤其是在SCI论文发表过程中难以获得认可。

网络生物学将多种生物分子间的联系和相互作用抽象地用网络表示，通过对网络的分析去理解生物系统的功能，特别适合作为复杂疾病和中药药理学的研究工具。近年来，网络生物学的方法已成功应用于复杂疾病和药理学研究，产生了网络医学、网络药理学等新兴的研究学科分支。将网络药理学应用于中药复方研究，产生了中药网络药理学，这种方法打破了传统的中药复方机制研究的瓶颈，使得原先难以定性的机制得以预测和验证。作为临床医生、科研人员和硕博士研究生，尤其是没有生物信息学分析基础和网络生物学基础的初学者，面对自己实验获得的大量错综复杂的基因组学、蛋白质组学数据时，难免会无从下手分析。不知道如何去解析一个复杂疾病的机理或一个中药复方的作用机制，如何去挖掘成分-靶点之间的关系，如何将药物作用机制和疾病机制相关联？如何利用免费的数据挖掘，为自己的中药复方研究增添亮点？如何利用生物信息学技术，解析中药复方作用机制？

本次学习班将带领广大学员，共同学习将网络生物学的研究方法用于复杂疾病和中药复方研究。现场实战教学，带领学员解析复杂疾病病理和中药复方作用机制，学员也可以将自己的实验数据带来学习班，利用课间时间进行分析。

 

主办单位：

莫速乎科研教育（上海莫速乎教育投资有限公司）；上海荆麦信息科技中心

 

课程内容、目标与特色：

本次学习班将采用小班教学（30人以下），确保学习质量。授课老师是国内此方面顶尖专家，老师将以最简单易懂的方式介绍复杂疾病和中药复方研究所用到的网络生物学的数据、方法和技术，并以中药复方解析的工作流程为线索，讲授如何一步一步地研究复杂疾病和挖掘中药复方的作用机制。本学习班全部采用免费数据库和在线分析工具，学员不需要编写程序。

本次学习班全程电脑实战教学，90%以上为上机指导操作，无繁琐的理论授课，做到课程学完，就能独立分析复杂疾病、解析中药复方。已举办多期、往期学员评价极高。微信建群会后与讲师持续讨论学习。

 

适合对象：

各级医院临床医生、药师、科研单位研究人员、高校硕/博士研究生、对利用网络生物学研究复杂疾病、药物机制及中药复方感兴趣的广大师生（尤其适合初学者和无基础的学员，无需任何基础，也无需学习任何编程语言，轻松分析复杂疾病和中药复方）。

 

课程设置：

时间	内容安排
23日	13:30-17:00报到（晚上到达者先办理入住，24日早晨报到）
24日	研究涉及的网络生物学基础知识、数据来源和实用技能
	主要内容：
	1、分析基于网络生物学的复杂疾病和中药复方研究的SCI论文各一篇，解析数据分析要点和论文写作模式
	2、基因映射：不同模式生物的同源基因映射；同一物种的不同基因ID转换（上机实践）
	3、利用在线工具DAVID进行关注基因（疾病基因或药物靶点）的GO富集分析、富集通路分析（上机实践）
	4、背景网络数据获取：蛋白相互作用、基因关联网络数据库，以及不同背景网络的特点（上机实践）
	5、利用Cytoscape软件构建和分析网络：网络构建；基本拓扑特征的计算；重要节点识别；模块分解；网络可视化；Cytoscape插件的安装和使用等；网络拓扑指标的含义介绍（上机实践）
	6、关注基因（疾病基因或药物靶点）影响的子网络的构建（上机实践）
	备注：第2-6个问题，将以一个以小鼠疾病模型的基因芯片结果为案例，一步一步地指导学员分析数据，获得结果
25日	复杂疾病和复方中药研究的数据来源和实用技能：以中药复方研究为主线索
	1、中药有效成分的查找和获取（上机实践）
	常用中药数据库及使用方法
	2、中药有效成分对应靶点的查找和获取、对比药物及其靶点的获取（上机实践）
	介绍分子对接方法、化学相似性方法以及数据库查询方法获取中药有效成分的靶点；介绍PubChem, STITCH,DrugBank等数据库的使用方法。主要内容：
	（1）常用中药数据库及使用方法
	（2）用PubChem查询化合物信息
	（3）用化学相似性查找化合物靶点
	（4）基于药效团模型的药靶预测
	（5） 用分子对接验证化合物的靶点
	3、查找和获取中药所治疗疾病的相关基因、构建相关疾病网络、识别疾病影响的通路（上机实践）
	介绍通过疾病相关基因获取方法、GEO数据库中基因芯片数据的获取和分析，用DAVID识别疾病影响的信号通路和生物学过程，疾病相关子网络的构建
	以Alzheimer's disease 为例，介绍如何在OMIM, DisGeNet , GEO数据库中查询与疾病相关的基因
	4、确定中药作用靶点所调控的信号通路和网络，评价中药对疾病网络的影响（上机实践）
	介绍用DAVID识别药靶蛋白影响的信号通路和生物学过程，基于CMAP的药物机制评价，药物影响子网络的构建以及子网络中重要蛋白的识别
	以第一天的小鼠疾病模型的基因芯片结果为例，介绍如何用CMAP分析针对此芯片的显著表达基因，可能的抑制或促进的药物，并用drugBank查询相应药物的相关信息。
备注：自带笔记本电脑，安装WINDOWS操作系统及Office Excel 2010等软件。

 

时间地点：

上海丰鑫国际大酒店 2018/03/24-25 (23日报到，课程2天) 

-主办方介绍-