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基因组遗传变异与数据分析实用技术培训班

基因组遗传变异与数据分析实用技术培训班

2017-12-26 08:00:00 至 2017-12-28 18:00:00

北京   北京市计算中心

中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会   

优惠信息:

2017-11-30 00:00前,会务费优惠价¥3600.0,原价¥3800.00
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发票开具:增值税普通发票 增值税专用发票

-会议内容-

随着深度测序技术的发展与成熟,产生了海量的基因组的数据,通过全基因组重测序的序列比对,研究者可以找到大量的单核苷酸多态性位点(SNP)、拷贝数变异(CNV)、插入缺失(InDel)、结构变异(SV)等变异位点。并通过对已知全基因组序列的物种进行测序,来研究个体或群体间的相关变异信息,从而找出与疾病、性状、以及功能有关的基因,进行个体或群体分子水平的差异分析。随着测序成本的大幅度降低以及测序效率的数量级提升,再加上已知基因组序列的物种增多,全基因组重测序已成为动植物物种遗传差异研究、功能基因挖掘等最可靠的方法。北京市计算中心举办《基因组遗传变异与数据分析实用技术培训班》,目的就是为统计遗传学领域的专家学者、计算系统生物学家、从事复杂疾病遗传易感性研究的专业人员、生物信息科学工作者、研究生提供一个互相交流的平台,并为今后的项目交流和相互合作创造条件。

主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会

承办单位:北京市计算中心

协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室

          中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会

          北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

          中国生物工程杂志

          北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司

    北京微生太科技有限公司

培训地点:北京海淀区丰贤中路73号楼,北京市计算中心三层会议室

本次课程时间: 2017.12.26-28  上午:930 - 1200  下午:130 – 500

-主办方介绍-

中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会 中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会

中国生物工程学会(Chinese Society of Biotechnology,CSBT)成立于1993年,首任理事长:谈家桢院士,现任理事长:高福院士。中国生物工程学会成立以来,主办、承办、协办了多个国际、国内学术交流活动,为促进生物技术与生物产业发展、提高国民素质、促进经济和社会发展等方面发挥了重要作用。

日期

时间

授课题目

授课内容

第一天

上午

生物信息学概述及NGS原理与应用

  1. 生物信息学知识背景概述;
  2. 二代测序(NGS)的基本概况和技术发展简介;
  3. NGS建库原理与技术;

下午

Linux上机操作及生物信息学软件安装及使用 (上机操作)

  1. linux基础与基本操作;
  2. 生物信息学软件应用及常用软件介绍;
  3. 重测序相关分析软件介绍及安装;

第二天

上午

基因组重测序技术应用理论与策略

  1. 基因组重测序的理论与研究方法及意义;
  2. 全基因组数据分析策略;
  3. 全外显子数据分析方法与应用;
  4. 目标区域测序的策略应用与技术前沿应用;

下午

基因组变异分析 (上机操作)

  1. 重测序的分析流程;
  2. 原始测序数据的质控及过滤;
  3. 学习BWAsamtools等工具的使用,进行calling SNP,INDEL
  4. sam/bam文件处理、VCF文件与基因组变异位点分析

第三天

上午

基因组变异分析 (上机操作)

  1. 利用重测序数据检测拷贝数变异(CNV);
  2. 利用重测序数据检测易位、转置等结构变异(SV

下午

基因组变异注释与功能分析

(上机操作)

  1. 基因组注释工具Annovar的应用;
  2. 功能分析工具David的使用;
  3. 基因组变异数据库GenecardHGMD等以及功能分析的应用;
  4. 药物基因组学与靶向药突变位点查询;
  5. 基因组变异位点筛选与过滤分析

(课程内容以实际授课为准)

-会议门票-

【报名费用】

培训费:3800元,含听课费、材料费、上机费。请自带笔记本电脑用以上机实习。 材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。食宿自理,酒店自行预定。

【报名优惠政策】

11130日前报名缴费可优惠200元。

23人以上团体报名每人可减少300元;

34+1团报,可免费赠送一个名额;

上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

-场馆介绍-

北京市计算中心 北京市计算中心

北京市计算中心建立于一九七三年,是国内最早一批计算中心之一,是中国最早、最具影响力的从事计算机应用技术研究及推广的机构,服务对象则涉及工业、商业、交通、能源、环保金融、税务、社会事务等多个领域。北京市计算中心自成立以来,完成了上百项国家和北京市政府有关部门委托的研究项目和面向多种用户的服务型项目。先后获得国家及省部级成果奖30多项、,拥有了200余项国际国内领先的技术和产品,为中国计算机的普及、应用和发展做出了杰出贡献

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