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2019宏基因组学核心技术应用培训班(北京)

2019宏基因组学核心技术应用培训班(北京)

2019-01-17 08:00 至 2019-01-20 18:00

北京   None

中国管理科学研究院职业资格认证培训中心   

报名截止

推荐会议:2025第十三届国际基因节

发票类型:增值税普通发票 增值税专用发票

参会凭证:现场凭电话姓名参会

-会议内容-

各企事业单位、高等院校及科研院所:

随着新一代测序技术的迅猛发展及应用,研究宏基因组的方法已经发生了翻天覆地的变化。基因组学的研究成果日新月异,短短几年来,宏基因组学的研究已经渗透到各个领域,从海洋到陆地,再到空气,从白蚁到小鼠,再到人体,从发酵工艺到生物能源,再到环境治理。在获得海量的数据后全面地分析微生物群落结构、基因功能组成等成为广大科研工作者的普遍问题。

中国管理科学研究院职业资格认证培训中心特举办“宏基因组学核心技术应用培训班”。本次将围绕基因组学研究的最新进展,讨论基因组学技术在生命医学等研究领域的创新性突破和应用,解决科研工作者在宏基因组样品制备、数据分析、功能基因挖掘等的困扰,对前沿的宏基因组学核心技术应用进行了全面的讲解,同时进行深入的案例分析,帮助学员掌握和利用深度学习进行具体工作的开展。具体通知如下;

培训目标:

    1、采用深入浅出的方法,结合理论并配以大量实例练习,重点讲解宏基因组学训练过程技巧。针对工作中存在的疑难问题进行分析讲解和专题讨论,有效的提升学员解决复杂问题的能力

    2、从工作中的实际需要出发,精心挑选宏基因组研究项目中实用的上机软件,并为每位学员提供实际操作的机会,实现从宏基因组理论知识掌握到实际研究应用的转化。

    3、理论讲解与实践演练结合,讲师授课演示与学员研讨讨论穿插进行。提供与专家面对面探讨项目中个性化问题的机会。

主讲专家:

    主讲老师来自中国科学院微生物所、遗传发育研究所、基因组研究所、生物物理研究所等本领域一线技术专家,拥有丰富的科研及工程技术经验,长期从事微生物学、宏基因组学、生物信息学等领域的教学与研究工作。

时间地点:

2019年01月17日— 2019年01月20日   北京

   (第一天全天报到,授课三天,机房上课)

-主办方介绍-

中国管理科学研究院职业资格认证培训中心 中国管理科学研究院职业资格认证培训中心

中国管理科学研究院职业资格认证培训中心是依照国务院有关指示精神,并经过中国管理科学研究院专家、领导们严格考察、审核批准后,并由研究院专家、领导们剪彩,挂牌成立的国家事业性直属分支机构。

课程大纲:

一、宏基因学研究的发展和挑战

1、宏基因组研究的发展历史  2、典型的宏基因组研究及应用

3、两种宏基因组研究的策略  4、宏基因组数据分析中的挑战

5、数据分析过程中的编程简介6、

二、基本的宏基因组实验技术和单细胞宏基因组实验技术

1. 宏基因组学简介(相关概念,主要研究内容,3大宏基因组学研究计划等)

2. 样品采集及meta DNA提取(不同来源样品如何采集、保存、运输等,细胞富集、破碎以及DNA提取与检测的方法和相关注意事项)

3. 基于16S rRNA基因的实验策略(16S扩增引物选择、快速文库制备、筛选策略的选择等)

4. 基于全基因组测序的实验策略(克隆文库构建、高通量测序文库制备及质量检测)

5. 功能宏基因组实验策略(荧光标记物的选择,流式细胞仪简介及细胞分选原理,微流控芯片工作流程,单细胞实验流程等)

6、单细胞宏基因组实验技术

三,linux常用命令使用和上机操作、基于16s rRNA测序的宏基因组数据分析技术

1、linux常用命令使用和上机操作        

2、16S rRNA简介及研究案例              

3、16S rRNA测序分析的一般流程

4、数据资源及软件工具介绍

5、不同测序数据分析的比较

6、其他软件介绍与操作

7、功能基因的预测分析 \代谢通路分析

四,基于shotgun测序的宏基因组数据分析技术

一、WGS测序分析的一般流程

1 流程概览                    2 文库构建和测序方式选择

3 质量控制和污染序列去除      4 序列整合和分选

5 NR-BLAST和MEGAN分析        6 序列拼接和基因预测注释

7 循环处理

二、经常使用的数据资源和工具(重点)

1 NR/MG-RAST和reference     2 RAPSearch和alignment

3 MEGAN和classification     4 SOAP-denovo和assembly

5 BWA/inGAP和mapping

三、数据统计与结果展示(重点)

1 测序量和拼接效率            2 从比对文件中提取信息

3 物种/功能分类和组成         4 群落结构多样性

5 聚类和相关性

四、WGS测序分析的典型案例

1 人类微生物组计划-HMP          2 地球微生物组计划-EMP

3 反刍动物胃宏基因组            4 环境病毒组和噬菌体

5 从相关案例看WGS的优势

五、一些工具的操作演示(上机) 

五、宏基因组研究的难点:宏基因组拼接\非拼接策略的数据分析

1.宏基因组拼接必要性

2.基因组拼接组装算法原理和流程

3.宏基因组拼接的特点及难点

4.基于非拼接的宏基因组研究策略

5.上机操作,SOAPdenovo2, MetaIDBA, SPAdes等软件的使用

六,QIIME在宏基因组分析中的应用(上机操作)

1、单样品物种多样性分析

A)序列聚类OTUs(Operational Taxonomic Units)

B)测序深度判定(Rarefaction Curve)

C)物种多样性及丰度分析(Relative Abundances)

2、多样品物种多样性分析,包括以下内容:

A)多样品OTUs比较(OUT Heatmap、Venn图)

B)多样品相似度比对(UPGMA 聚类分析)

C)多样品群落构成比较分析(柱状图)

D)Weighted PCA(Principal Component Analysis)分析

E)Unweighted PCA分析

F)组间差异显著性分析

十一、辅助课程

(1)疑难解答、分组讨论;

(2)学后交流、微信群、QQ群建立;

培训对象:

从事微生物学、基因组学、病理学、生态学、酶学、蛋白质组学、植物病理学等领域相关的企事业单位技术骨干、科研院所研究人员和大专院校相关专业教学人员及在校研究生。

培训方式:

1,理论解析        2,案例上机实操         3,研讨提问         4,关键问题解疑

-会议门票-

培训费用:

A类,每人3900元(报名费、培训费、资料费、证书费、考试费等、后期技术咨询费)

B类,每人4380元(报名费、培训费、资料费、证书费、考试费等、后期技术咨询费)

注:住宿可统一由会务组进行安排,费用自理。

颁发证书

参加相关会议并通过考试的学员,可以获得:

A类,中国管理科学研究院职业资格认证培训中心颁发的《宏基因组学应用开发工程师》(高级)专业技能资格证书,官方网站查询,该证书可作为有关单位专业技术人员能力评价、考核和任职的重要依据。

B类,颁发《基因组学工程师》(高级)岗位能力证书,由人力资源与社会保障部高级公务员培训中心主办中国人事人才培训网官方查询,该证书直接纳入高新技术人才数据库。(加上A类共两本证书)。

注:请学员带两寸彩照两张(背面注明姓名)、身份证复印件和学历证明复印件各两张。

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