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2018芯片及测序高通量数据关键靶标基因筛选分析学习班

2018芯片及测序高通量数据关键靶标基因筛选分析学习班

2018-10-13 09:00 至 2018-10-14 18:00

北京   北京邦泰宾馆

莫速乎科研教育(上海莫速乎教育投资有限公司)   

50人

报名截止

推荐会议:2024(第七届) 世界细胞治疗与再生医学大会暨展览会

发票类型:增值税专用发票 增值税普通发票

参会凭证:邮件/短信发送参会通知

-会议内容-

芯片及测序高通量数据关键靶标基因筛选分析学习班

莫速乎教育独有特色发放课程视频供复习保障学习效果

北京  2018/10/13-14


关键靶标分析是指基于生信的方法从芯片及测序高通量数据中挖掘到与研究方向最相关的靶标基因(mRNA,miRNA,lncRNA或蛋白)。随着高通量手段的不断进步,测序和芯片的成本也逐渐降低,速度也越来越快,使用高通量手段(测序/芯片)进行科研的优点非常明显,也是大势所趋!

做过测序或者芯片实验的科研人员越来越多,虽然测序公司已经给出了一部分的数据分析,比如过滤、质控比对、定量和差异等,但是这些分析属于基础傻瓜式的标准分析,并不能完整的讲一个故事!我们也很难在大量的差异基因中筛选获得关键基因。因此,需要我们自己掌握高通量数据挖掘的能力,从海量信息中获得自己想要的关键基因!

学习预期:通过整整两天的强化训练,掌握生信文献分析思路和八个实用操作知识点,可以独立完成一篇基于公共数据库的高通量数据挖掘分析,获得一套属于自己的分析结果。

内容安排:


通过该主题的学习,可以学会:

1.       高通量公共数据的详细信息查找/下载;

2.       在线做差异表达分析

3.       在线blast分析

4.       基因ID转换

5.       通路map图制作

6.       功能富集分析

7.       蛋白互作分析

8.       网络图的构建和美化。



时间地点:

北京邦泰宾馆 2018/10/13-14  (12日周五报到)

北京市丰台区西局西街300号(九号线七里庄地铁站下B口出即到)


主办单位:

莫速乎教育(上海莫速乎教育投资有限公司);上海荆麦信息科技中心


备注:某些单位需提前借款的可先报名并索取pdf版邀请函,打印后用于向单位借款。缴费后请将汇款凭据截图或拍照,并发送邮件到mosuhu@163.com告知详情以备核实。某些单位需要现场刷公务卡的请报名时备注以便合理安排座次。


参会要求:

1、 请自带笔记本电脑。会场我们会布置足够电源插座。请确保电脑安装的是WINDOWS的操作系统

2、 所用软件会前一周发到报名邮箱自行下载安装或报到时拷贝。

3、 会议期间发放经盖章的纸质邀请函、发票供报销使用。根据近几年经验,所有学员都能顺利报销,敬请放心。

-主办方介绍-

莫速乎科研教育(上海莫速乎教育投资有限公司) 莫速乎科研教育(上海莫速乎教育投资有限公司)

莫速乎科研教育,简称莫速乎,原名“多圈课堂”,创立于2012年12月,隶属于上海莫速乎教育投资有限公司。2014年3月更名为“莫速乎科研教育”,品牌名源于我国古代著名教育家《荀子·劝学》“学之经 莫速乎”。莫速乎旨在通过独创的EAT理念打造最易接收并最能提高实际技能的高清视频课程,以作为科研传统教育的补充或替代。同时将持续开展现场研讨班,以弥补视频课程之不足。EAT理念以荀子思想为根基,并从“学”的角度优化教学,且课程策划符合哲学的认识论规律,是目前“最符合人性”的教学理念。在课程策划方面,我们坚信每个小领域只需要一部课程,一部优秀的课程,经典的课程,足可供全国千百万人学习,莫速乎正是立志于打造每个小领域内的这一部课程。

时间安排

课程表

介绍



9:00~10:20

生信简介

生物信息介绍

测序标准报告解读

经典生信SCI文章的解读

10:40~12:00

常用数据库及工具

NCBI数据库:最权威的基因综合数据库之一。

GEO数据库: 数据量最大的高通量公共数据库。

GEO2R工具:在线做差异分析的R工具

Uniprot: 最权威的蛋白综合数据库之一。

TCGA数据库:最全的癌症高通量数据公共库(简介)

13:30~15:00

DAVID工具——功能富集分析

功能富集的原理和意义

通路(pathway)的简介

基因ID转换

        基因功能注释(GO ,pathway)

        基因功能富集(GO ,pathway)

        基因功能聚类(GO , pathway)

15:20~17:00

聚类热图及pathway map图

KEGG 数据库:最权威的通路数据库(pathway map 分析)

HEMI软件:构建聚类热图的本地软件




9:00~10:20

STRING数据库基因/蛋白相互作用分析(PPI)

        蛋白互作分析的原理和意义;

        单个蛋白的蛋白互作分析;

        多个蛋白的蛋白互作分析;

        STRING工具的使用步骤:输入、参数设置、输出等。

10:40~12:00

网络做图软件

cytoscape软件下载安装

简介和界面初识。

        逐个修改节点的属性和修改边的属性

        网络展示方式更美观

        网络统计分析

13:30~15:00

网络做图软件

        Cytoscape输入文件生成

批量修改节点的属性和修改边的属性

        Cytoscape的常用插件:ClusterONE

        Cytoscape的常用插件:BinGO

15:20~16:30


 整体演练、问题回复

主讲老师简介:

主讲老师宋老师有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。曾参与完成过肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析,个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发构建及近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;曾在上海、沈阳、济南、武汉等城市举办过十几场线下学习班,有丰富的授课经验。

-会议门票-

注册费用:

3200元/人  按交费先后顺序安排座次,注册费包含会场、教材、专家讲课费、视频课程等费用,不含住宿费。

优惠策略:

1.   学生或三人(含)以上团体每人减200元;

2.   10月6日前(含)缴费每人减200元;

3.   以上优惠可叠加;

4.   必须现场刷公务卡的提前支付宝转1千元定金算提前缴费(现场刷卡时退还)。

住宿:(不强行规定,可自己预订附近其他酒店,费用自理)

北京邦泰宾馆

北京市丰台区西局西街300号(九号线七里庄地铁站下B口出即到)

标准间/单间: 340元/间/晚     (含早餐、含宽带)

备注:住宿统一安排,费用自理,办理住宿时告诉前台是参加此学习班的即可,住宿费办理住宿时交给酒店前台。住宿费发票将在退房时由酒店开具给您。

-场馆介绍-

北京邦泰宾馆

交通指南:

位置交通

  • 地铁站:

    七里庄地铁站 245m

    西局地铁站 955m

    六里桥地铁站 1.5km

  • 火车站/机场:

    丰台站 2.3km

    北京西站 3.8km

    北京南站 7.5km

    北京北站 9.7km

    南苑机场 12.5km

    首都国际机场 34.5km

  • 热门景点:

    华堂商场丰台北路店 255m

    丰台体育中心 1.3km

    国美六里桥店 2.0km


北京邦泰宾馆是隶属于阳泉煤业集团有限责任公司的国有企业,位于丰台区丰北路与万丰路交汇处以北100米路口西北侧,北通京石高速,南接丰北路快速联络线,东距北京西站3公里,毗邻六里桥交通枢纽和丽泽桥长途客运站,距公主坟商业区及万寿路地

会议标签:

网络做图 cytoscape 数据库 DAVID 生物信息学

温馨提示
酒店与住宿: 异地参会客户请注意,为防止会议临时变动,建议您先与活动家客服确认参会信息,再安排出行与住宿事宜。
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