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2018基因组关联分析技术应用培训班

2018基因组关联分析技术应用培训班

2018-05-24 09:30 至 2018-05-26 17:00

北京   北科产业3号楼

中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会   

报名截止

推荐会议:2024(第七届) 世界细胞治疗与再生医学大会暨展览会

发票类型:增值税普通发票 增值税专用发票

-会议内容-

以“共变法”思想为核心的关联分析是研究人类复杂疾病的主要手段,其与以“求同法”思想为核心的“序列比对(Blast)”同样重要,但方法学却复杂得多。北京市计算中心生物计算事业部,主要针对具备一定统计学、遗传学、分子生物学基础的人类医学领域研究人员,特开设基因组关联分析培训班。

主办单位

中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会

承办单位

北京市计算中心

协办单位

云计算关键技术与应用北京市重点实验室

中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

中国生物工程杂志

北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司

北京微生太科技有限公司

北京依托华茂生物科技有限公司

举办地点:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
培训时间:2018.5.24-26上午9:30-12:00,下午13:30-17:00

培训特色
无需任何计算机语言基础
深入简出,内容精要实用
结合人类医学、动植物育种等生物学数据背景知识与实例讲授
统计学原理+模型/算法+编程实现+生物医学应用
边学边练,重实践,力求实效
小班授课,个别辅导

-主办方介绍-

中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会 中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会

中国生物工程学会(Chinese Society of Biotechnology,CSBT)成立于1993年,首任理事长:谈家桢院士,现任理事长:高福院士。中国生物工程学会成立以来,主办、承办、协办了多个国际、国内学术交流活动,为促进生物技术与生物产业发展、提高国民素质、促进经济和社会发展等方面发挥了重要作用。

日期

授课题目

授课内容

第一天

基因组关联分析理论基础

1.基因组学与生物信息学概述;

2.基于群体遗传的数据获取;

3.基因组关联分析的原理、数模、策略及常用软件介绍;

4.常用GWAS数据库介绍;

Plink软件基础应用

5.Plink软件应用;

6.Plink文件格式生成与解析;

7.等位基因频率计算;

8.哈-温平衡计算;

9.目标区域数据提取;

10.基因组关联分析流程;

11.关联分析结果分析与p校正;

第二天

基因型填充Imputation

12.基因型填充Imputation的原理及应用;

13.Beagle软件介绍与应用;

14.基因组填充的方法与分析流程;

15.1000G数据应用

Plink软件进阶应用

16.基于家系的关联分析;

17.曼哈顿图的绘制与结果展示;

18.SNP位点的condition分析;

19.Meta gwas数据分析;

第三天

Haploview软件

20.Haploview软件应用;

21.Haplotype单倍型分析;

22.LD连锁不平衡指数计算;

23.SNP marker之间的r2、D值等计算;

Tassel软件

24.Tassel软件应用;

25.Tassel基于命令行的批量数据分析;

26.生物多样性指数、PCA、遗传距离计算等;

-会议门票-

注册费:4000元/人(含听课费、资料费(材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。)、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)。  

【报名优惠政策】
1、4.20日前报名并缴费,可享受减免200元优惠;
2、3人以上团体报名每人可减少300元;
3、4+1团报,可免费赠送一个名额
4、上面3种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

-场馆介绍-

北科产业3号楼 北科产业3号楼

北京中关村永丰高新技术产业基地位于海淀区北清路99号。按不同的用地性质规划为4个工业生产区、一个公共服务中心和一个生活居住区。规划建筑面积386.85万平方米,规划绿地率35%,总容积率0.99。基地内科研、工业区用地207.16公顷,重点吸纳新材料产业、信息产业、生物工程与新医药产业、环保及资源综合利用产业、光机电一体化产业、空间技术产业等经济效益好、科技附加值高、技术密集的绿色环保无污染的高新技术产业。科研、工业1区位于基地西北部,用地面积82.68公顷,划分为77个地块,计划发展成为以纳米材料技术产业、超导材料技术产业、砷化镓和镁合金技术产业为主导的新材料产业园区。

会议标签:

基因组 基因

温馨提示
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