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单细胞测序与空间转录组数据挖掘课题设计培训班11月北京

单细胞测序与空间转录组数据挖掘课题设计培训班11月北京

2021-11-04 09:00 至 2021-11-07 17:00

北京   北京航空航天大学

北京仕而优教育科技集团有限公司   

60人

报名截止

推荐会议:Python生物信息从入门到进阶研讨会2023年2月培训班

发票类型:增值税专用发票 增值税普通发票 增值税普通发票

参会凭证:

-会议内容-

单细胞测序与空间转录组数据挖掘课题设计培训班

各企事业单位、高等院校及科研院所:

近年来,单细胞测序研究空前火热,重磅研究成果频出,越来越多的科研工作者开始使用单细胞测序这一基因表达研究利器。单细胞测序是从单个细胞水平对基因组和转录组进行的研究。通过全基因组或转录组扩增,进行高通量测序,能够揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态,反映细胞间的异质性。 相比于群体细胞测序,更适用于解决少量特殊样本的研究、异质性群体的分析及同时或互斥发生的基因组变化的查找等问题。单细胞测序技术在肿瘤、发育生物学、微生物学、神经科学等领域有重要应用,是现今生命科学研究的焦点。

为了让更多的科研人员及时全面的掌握单细胞测序技术,并应用到相应的领域研究中,特举办“单细胞测序数据挖掘与课题设计培训班”

 

本次培训由北京仕而优教育科技集团有限公司具体承办,相关事宜通知如下:

一、培训目标:

1、了解单细胞测序基本概念及原理

2、了解单细胞测序分析的数据分析及研究思路

3、学会R语言基本语法和绘图技巧,并用R代码进行单细胞转录组分析

4、掌握和利用单细胞测序技术进行具体工作的开展等

二、主讲专家:

    高级生物信息工程师,长期从事分子生物学专业研究,擅长生物信息数据分析,包括基因组组装,变异检测分析,单细胞测序,宏基因测序,精通linux系统,R语言,python语言等。

三、时间地点:

2021年11月04日—2021年11月07日      远程在线直播

2021年11月04日—2021年11月07日      北京

                                                  (第一天报到, 授课三天)

四、课程体系

理论讲解及实战(上机实践)

一、单细胞测序技术与应用

1. 单细胞组学技术发展历程和原理介绍。

2. 单细胞测序技术在科研领域的应用。

3. 近年单细胞技术CNS文章思路解析。

4. 单细胞文章常见图表解读。

5. 单细胞组学技术在癌症、发育、免疫及在植物等领域的研究内容及思路。

二、Linux及R语言入门与实操

1. 常规基础Linux命令入门讲解及实操训练。

2. R语言简介及安装,RStudio的安装及使用说明。

3. R语言语法介绍及常用命令。

4. 数据处理功能及统计应用。

5. R语言画图实操:tSNE,小提琴图,热图,网络图,GO、KEGG富集图,GSEA等图形绘制。

三、单细胞转录组数据分析思路及流程

1. 单细胞高分文章分析思路解析(细胞类群确定、拟时间分析、差异表达、通路富集、转录因子、配体受体互作等)。

2. 单细胞转录组比对、定量、分群及拟时间分析等软件及参数。

3. 单细胞转录组转录因子、功能通路及配体受体互作思路解析。

4. 单细胞组学分析常用数据库介绍及使用。

5. 基因富集分析和可视化。

四、单细胞数据可视化、细胞分型及marker鉴定

1. 10X官方单细胞软件Cellranger讲解及实操。

2. 从基因表达矩阵开始到marker基因筛选全过程讲解及实操。

3. 通过Seurat软件进行PCA及tSNE降维。

4. 单细胞转录组细胞鉴定及聚类分析。

5. 通过Seurat及GSVA等进行单细胞转录组差异分析。

五、单细胞数据轨迹分析,功能富集

1. 通过Monocle软件进行单细胞转录组拟时间分析。

2. 通过DAVID及metascape网站进行通路富集分析。

六、单细胞数据挖掘

1. 单细胞数据分析总结。

2. 归纳总结零成本单细胞数据挖掘思路。

3. 单细胞测序基金申请思路、准备内容及注意事项等。

辅助课程

单细胞测序,空间转录组等疑难解答、分组讨论;

学后交流、微信群、QQ群建立;

五、培训费用:

每人3900元(含培训费、证书费、资料费) 注:住宿可统一由会务组进行安排,费用自理。

六、颁发证书:参加相关培训并通过考试的学员,可以获得:

《生物信息工程师》(高级)专业技能资格证书,官方网站查询,该证书可作为有关单位专业技术人员能力评价、考核和任职的重要依据。

注:请学员带两寸蓝底彩照一张(背面注明姓名)、身份证复印件和学历证明复印件各一张。


-主办方介绍-

北京仕而优教育科技集团有限公司

-会议门票-

票种名称 价格 原价 票价说明
培训费用 ¥3900 ¥3900 每人3900元(含培训费、证书费、资料费) 注:住宿可统一由会务组进行安排,费用自理。参加相关培训并通过考试的学员,可以获得: 《生物信息工程师》(高级)专业技能资格证书,官方网站查询,该证书可作为有关单位专业技术人员能力评价、考核和任职的重要依据。

-场馆介绍-

北京航空航天大学 北京航空航天大学

交通指南:

海淀区学院路37号

北京航空航天大学(Beihang University),简称北航,由中华人民共和国工业和信息化部直属,中央直管副部级建制,位列“双一流”、“211工程”、“985工程”,入选“珠峰计划”、“2011计划”、“111计划”、“卓越工程师教育培养计划”,为国际宇航联合会、“中欧精英大学联盟”、“中国西班牙大学联盟”、“中俄工科大学联盟”成员,是全国第一批16所重点高校之一、80年代恢复学位制度后全国第一批设立研究生院的22所高校之一,也是新中国第一所航空航天高等学府。

北京航空航天大学成立于1952年,由当时的清华大学、北洋大学、厦门大学、四川大学等八所院校的航空系合并组建;1988年4月,国家教委批准,北京航空学院改名为北京航空航天大学;1989年,学校成为国家八五期间全国14所重点建设的高校之一;1997年,学校进入国家“211工程”建设高校行列;2001年,学校进入国家“985工程”建设高校行列;2011年,学校成为国家“珠峰计划”院校之一;2012年,学校入选首批“2011计划”。


会议标签:

单细胞测序

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