肿瘤免疫与新型细胞死亡课题设计及生信分析研讨会4月线上培训

肿瘤免疫与新型细胞死亡课题设计及生信分析研讨会

腾讯会议在线直播 2022年4月30日-5月1日

通过近几年的国自然项目以及文献发表来看，肿瘤微环境和新型细胞死亡方向的研究非常热门。无论是国自然资助的数量和金额，还是Pubmed发表的文献都是逐年增加的趋势。

肿瘤微环境（Tumor microenvironment，TME）是由肿瘤细胞、宿主细胞（基质细胞和免疫细胞）、以及相应细胞的分泌产物和细胞外基质（ECM）组成，同时也可能存在TME的代谢产物和特定的环境。肿瘤微环境是肿瘤赖以生存的“土壤”。肿瘤的生长与转移与周围环境息息相关，肿瘤可以通过释放细胞信号分子影响其微环境环境，促进肿瘤的血管生成和诱导免疫耐受，而微环境中的免疫细胞可影响癌细胞增长和发育。

通过发挥促肿瘤作用和抗肿瘤作用，浸润肿瘤的免疫细胞可以深刻影响肿瘤的进展以及抗癌治疗的成功。因此免疫细胞浸润是非常重要的研究方向，我们的科研人员开发了很多实用的分析数据库和分析工具。

在细胞死亡方面，除了大家耳熟能详的细胞凋亡、坏死性凋亡（necroptosis）、自噬外，一些新型细胞死亡方式的研究成为国自然的重要支持方向，包括细胞焦亡和铁死亡等。

细胞焦亡（Pyroptosis）又称细胞炎性坏死，是一种程序性细胞死亡，表现为细胞不断胀大直至细胞膜破裂，导致细胞内容物的释放进而激活强烈的炎症反应。细胞焦亡是机体一种重要的天然免疫反应，在抗击感染和激活肿瘤免疫微环境方面发挥重要作用。细胞焦亡是由gasdermin介导的细胞程序性坏死。

铁死亡(Ferroptosis)是一种铁依赖性的调节性细胞死亡方式。铁死亡的过程很复杂，由多种代谢物和生物分子组成，其中驱动基因、抑制基因、诱导因子和抑制因子是铁死亡的调控因子。铁死亡的核心标志是ROS激活的质膜脂质过氧化。

怎样基于自己的测序数据或公共数据库的数据（比如TCGA、GEO、EBI等）进行免疫细胞浸润分析或新型细胞死亡相关分析，常用的分析数据库以及分析工具的使用过程实操及结果解读是怎样的？

培训目标：

1. 掌握在肿瘤发生过程中固有和适应性免疫的重塑特点。

2. 详细了解肿瘤免疫逃逸的分子过程和分子机制。

3. 理解新型细胞死亡特点及其在肿瘤免疫微环境重塑中的作用。

4. 通过实例学习并掌握TIME课题设计思路和研究策略

5.了解最新最热癌症分析思路，免疫细胞浸润及铁死亡分析参与过程。

6.免疫细胞浸润相关数据库及工具学习（TIMER2.0, CIBERSORT, IMMUPORT, xCELL等）

7.铁死亡相关数据库及工具学习（FerrDb，KEGG）

8.国自然及高分文献中免疫细胞浸润及铁死亡分析相关图表生成制作。