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2019生信数据挖掘方法及TCGA、SEER等公共数据库的挖掘实战培训班(9月南京班)

2019生信数据挖掘方法及TCGA、SEER等公共数据库的挖掘实战培训班(9月南京班)

2019-09-21 08:00 至 2019-09-22 16:30

南京  

南京医格尔信息科技有限公司   

50人

报名截止

推荐会议:2024(第七届) 世界细胞治疗与再生医学大会暨展览会

发票类型:增值税专用发票 增值税普通发票 增值税普通发票

参会凭证:邮件/短信发送参会通知 现场凭电话姓名参会

-会议内容-

生信数据挖掘方法及TCGASEER等公共数据库的挖掘实战培训班


培训特色

1. 针对相关软件进行实操教学,掌握各类数据挖掘方法的实现;

2. 实操配合案例解析,完整解读各类数据挖掘方法的运用及结果分析;     

3. 深入讲解重点生物医学数据库的使用方法,结合数据库的在线工具和R语言编程分析各种类型数据;

4. 详细讲解公共数据库数据挖掘的研究策略,结合讲者的相关发文经验分享数据挖掘文章撰写的基本套路。


培训对象

从事医学、生命科学等相关专业的科研人员;

对生物医学数据挖掘及分析的具体方法有学习需求的医护人员、医学生、药企科研人员;

临床忙、没时间做实验或研究条件有限,希望将临床大数据应用与临床研究中并对SCI论文发表有迫切需求的医学生、临床医生及科研工作者。


会议主办单位

南京医格尔信息科技有限公司


会议承办单位

医盟V课堂平台

南京采卓生物科技有限公司

-主办方介绍-

南京医格尔信息科技有限公司

培训日程

9月21日

8:30-9:30     数据挖掘介绍

              数据挖掘简介

              数据的来源(可利用的数据、不同数据的异同点、不同数据的挖掘方法)


9:31-10:30    临床研究中生信数据应用实例分析与研究思路

              公共数据库在临床科研应用中的应用思路

              生信技术在临床研究中的应用思路及文献实例解析


10:45-12:45   R语言基础实操(上)

              数据分析处理


14:00-15:00   R语言基础实操(下)

              常用图表的制作


15:15-18:15   公共数据库数据检索、下载与分析处理

              TCGA数据库的功能介绍及实操

              GEO数据库的功能介绍及实操

              其他相关数据库的功能介绍及实操

9月22日

8;30-11:30    生物医学组学数据挖掘

              聚类分析(概念、常用聚类方法及R软件实现与可视化)

分类分析(决策树与随机森林原理、构建及结果的可视化等)

主成分分析(概念,应用及案例解析)

Logistic回归分析与生存分析(列线图及校准图绘制)

基因R的CancerSubtypes软件包的肿瘤亚型分析


10:45-12:45   基于数据挖掘的疾病关键调节分子(上)

              基于数据挖掘寻找关键疾病调控分子

              网络拓扑性质简介、分子网络数据库介绍

              案例讲解:应用网络拓扑性质识别疾病关键调控分子


14:00-15:00   基于数据挖掘的疾病关键调节分子的探索(下)

              构建网络及可视化(Cytoscape)

              Cytoscape软件介绍、Cytoscape插件简介


15:01-16:00   临床样本检测验证、后续结果分析与论文组装

              解读生物数据与临床数据的整合分析思路

              基于GEO与TCGA公共数据库挖掘的SCI论文写作与发表

             肿瘤基因表达与免疫浸润的最新研究热点

本期大咖

廖奇 副教授 宁波大学医学院

曾作为访问学者在哈佛大学丹娜法伯癌症研究中心进修

研究方向:非编码RNAs的生物信息学分析

研究成果:以第一作者或通讯作者身份在国际著名SCI期刊《Nucleic Acids Res》 (IF=10.162)等发表多篇论文。2010年,首次提出基因芯片中可检测长非编码RNA表达谱的设想,利用GEO数据库中重注释的基因芯片数据,构建长非编码RNA与蛋白编码基因的双色共表达网络,对长非编码RNA的功能进行大规模的预测,该工作目前已被引用超过200次,为长非编码RNA的功能注释领域开创了新的方法。主持多项国家自然科学基金、省自然科学基金、市自然科学基金,参编教材4部。目前同时担任浙江省生物信息学学会副秘书长,浙江省预防医学会卫生统计学专业和寄生虫专业委员会委员。


华琳 副教授 首都医科大学生物医学工程学院

研究方向:生物统计与生物信息学。

研究成果:主讲《医学统计学》、《医用数据挖掘》、《医药数理统计方法》、《临床及分子生物学大数据处理》和《生物信息学技术概论》等课程。擅长统计研究设计、各类型数据统计分析、生物医学大数据挖掘及生物信息学分析等,近5年内在相关领域以第一作者和通讯作者发表论文30余篇,其中SCI论文近20篇。主持和参与多项国家级、省部级和局级科研课题,与北京多家临床医院开展了数据分析方面的合作,并建立了良好的合作关系,目前是首都医科大学中青年骨干教师和北京市中青年骨干教师。

-会议门票-

注册参会价格

报名价格

报名价格

报名项目

价格(元/人)

线下培训

3199(原价3699)

线下培训+医盟V1会员(365天)

3899(原价4698)


团报价格

人数

优惠额度(针对团报总价优惠)

3-4

300

5-6

750

7人成团

1400


医学生凭学生证报名 立减200 (可与上述优惠同享),按缴费先后顺序确定座次

 注册费含会场、专家讲课费、教材、午餐、税费。不含住宿费、交通差旅费!

会议标签:

生物信息学 数据挖掘 TCGA SEER 数据库

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