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会议详情 |
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推荐会议：世界中医药学会联合会中医特色诊疗研究专业委员会第16届中医特色诊疗国际学术年会
发票类型：增值税普通发票 增值税专用发票
参会凭证：邮件/短信发送参会通知
背景介绍：
单细胞测序是从单个细胞水平对基因组和转录组进行研究。2015年以来，10X Genomics、Drop-seq、Micro-well、Split-seq等技术的出现，彻底降低了单细胞测序的成本门槛。自此，单细胞测序技术被广泛应用于基础科研和临床研究。通过单细胞测序可以最大程度的反映细胞的异质性，发现新的细胞群和细胞亚群，并为阐明细胞状态转换的调控机理提供了技术保障。目前在公共数据库中的单细胞测序几乎都围绕常见模式生物来做。人，小鼠，斑马鱼等，涉及正常组织、血液、不同发育阶段样本，疾病类型也各种各样包括肿瘤、免疫细胞、炎症类甚至包括较难研究的神经、肌肉、骨骼等。最重要的是，这些数据一直在增加。是现今生命科学研究的焦点。
时间地点：
2021年1月23日—1月24日 腾讯课堂
课程特点：
本次课程以近期CNS文章为案例主线，逐一详细剖析，全程电脑实战教学。理论与实践相结合，老师将以最简单易懂的方式，既介绍单细胞测序的研究方法、分析内容和最新前沿进展，又介绍具体的数据库、工具和软件的使用，并在课堂上进行上机指导。讲师经验丰富，教学深入浅出，能让大家获得从单细胞组学原始数据实现CNS图形绘制的实战能力。让每一个接受培训的学员能够从中真正获益。
授课专家：
本次授课老师来自中科院系统，长期从事单细胞多组学方面的项目研究，目前已在Nature等杂志发表文章四十多篇，承担国家科技部、国家自然基金委和重点研发计划等多项课题。拥有丰富的科研技术经验，具有资深的技术底蕴和专业背景。
参会对象：
医学、生物、农业等专业的各级临床医生、药学、科研单位研究人员、高校硕/博研究生、对利用单细胞测序或公共数据库进行数据挖掘感兴趣的广大师生（尤其适合初学者和无基础的学员，无需任何基础，也无需学习任何编程语言）
课程安排：
课程安排 | |||
第一天上午 | 9:00-10:30 | 单细胞测序技术与应用 | 1. 单细胞组学技术发展历程和原理介绍。 |
2. 单细胞测序技术在科研领域的应用。 | |||
3. 近年单细胞技术CNS文章思路解析。 | |||
10:30-10:45 | 茶歇 | ||
10:45-12:00 | 单细胞测序图标解读及思路 | 4. 单细胞文章常见图表解读。 | |
5. 单细胞组学技术在癌症、发育、免疫及在植物等领域的研究内容及思路。 | |||
12:00-13:30 | 午餐及午休 | ||
第一天下午 | 13:30-15:30 | Linux及R语言入门、软件安装 | 1. 常规基础Linux命令入门讲解及实操训练。 |
2. R语言简介及安装，RStudio的安装及使用说明。 | |||
3. R语言语法介绍及常用命令。 | |||
15:30-15:45 | |||
15:45-17:00 | R语言数据处理实操 | 4. 数据处理功能及统计应用。 | |
5. R语言画图实操：tSNE，小提琴图，热图，网络图，GO、KEGG富集图，GSEA等图形绘制。 | |||
17:00-18:00 | 晚餐及休息 | ||
第一天晚上 | 18:00-21:00 | 单细胞转录组数据分析思路及流程 | 1. 单细胞高分文章分析思路解析（细胞类群确定、拟时间分析、差异表达、通路富集、转录因子、配体受体互作等）。 |
2. 单细胞转录组比对、定量、分群及拟时间分析等软件及参数。 | |||
3. 单细胞转录组转录因子、功能通路及配体受体互作思路解析。 | |||
4. 单细胞组学分析常用数据库介绍及使用。 | |||
5. 基因富集分析和可视化。 | |||
第二天上午 | 8:45-10:30 | 单细胞数据可视化、细胞分型 | 1. 10X官方单细胞软件Cellranger讲解及实操。 |
2. 从基因表达矩阵开始到marker基因筛选全过程讲解及实操。 | |||
3. 通过Seurat软件进行PCA及tSNE降维。 | |||
10:30-10:45 | 茶歇 | ||
10:45-12:00 | 单细胞数据marker鉴定及差异分析 | 4. 单细胞转录组细胞鉴定及聚类分析。 | |
5. 通过Seurat及GSVA等进行单细胞转录组差异分析。 | |||
12:00-13:30 | 午餐及午休 | ||
第二天下午 | 13:30-15:00 | 单细胞数据轨迹分析，功能富集 | 1. 通过Monocle软件进行单细胞转录组拟时间分析。 |
2. 通过DAVID及metascape网站进行通路富集分析。 | |||
3. 单细胞数据分析总结。 | |||
15:00-15:15 | 茶歇 | ||
15:15-17:00 | 单细胞数据挖掘思路及标书构思、准备 | 1. 归纳总结零成本单细胞数据挖掘思路。 | |
2. 单细胞测序基金申请思路、准备内容及注意事项等。 | |||
备注：上课主要软件为R和Rstudio，涉及部分Linux系统，讲师会详细带着操作； | |||
| 票种名称 | 价格 | 原价 | 票价说明 |
| 早鸟票 | ¥2600 | ¥2600 | 发票可开：培训费、资料费、会务费、会议注册费； |
| 普通票 | ¥2800 | ¥2800 | 发票可开：培训费、资料费、会务费、会议注册费； |
| 团购票 | ¥2500 | ¥2500 | 发票可开：培训费、资料费、会务费、会议注册费； |
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