2019 TCGA高通量数据挖掘研究技术会议（11月上海班）

-会议内容-

各企事业单位：

癌症是临床医学中非常重要的疾病方向。TCGA数据库中包含了常见了40种癌症方向（含30000个样本）的高通量数据及临床信息。大家对TCGA数据库的使用近几年也在逐渐增加。因此，需要我们自己掌握高通量数据挖掘的能力以及逻辑性的生信分析思路，从海量信息中获得自己想要的关键基因！

随着大数据时代的到来，各种生物类公共数据库井喷，其中就包括癌症领域熟为人知的癌症基因图谱The Cancer Genome Atlas (TCGA)数据库。临床科研人员有没有一种方法可以不做实验不查病史，直接调用现有数据发表SCI论文呢？癌症公共数据库即提供了这样的可能。本次学习班讲授癌症领域熟为人知的癌症基因图谱The Cancer Genome Atlas（TCGA）数据库。TCGA由NCI牵头，作为美国攻克癌计划的一个大项目，系统提供了癌症多组学测序和芯片数据，包括Gene expression, DNA methylation, Copy Number Variation, Mutation等结果，同时也附有相应各测序样本的完整临床资料。TCGA为肿瘤基础医学和转化医学研究者提供了海量的基因组数据和与其关联的临床数据,这为挖掘有意义的基因组变化和发现影响肿瘤起始、发展、分化、转移等生物学机制提供了海量数据基础。

 

学习目标：

通过整整两天的培训，掌握TCGA数据库的使用、下载及分析思路和实用操作知识点。

1：T CGA数据下载与临床数据清理

2：差异表达分析、火山图、pathway分析

3：TCGA临床数据基线分析及功能富集分析

4：生存分析，生存作图

5：临床预测模型建构

授课方式：

1、课堂讲授与上机操作相结合；

2、专题研讨与案例讲解分析结合；

3、课后加微信群答疑。

 

-主办方介绍-