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RNA甲基化(m6A)数据分析与课题设计研讨会
2021年7月3-4日 腾讯会议网络会议室/北京金泰绿洲酒店
【会议背景】
6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)是指腺嘌呤(A)的第6 位氮(N)原子上发生的甲基化修饰。m6A修饰是mRNA与lncRNA最常见的核苷酸修饰。m6A修饰广泛分布于真核生物的RNA 中,m6A修饰调节RNA 成熟、剪切、转运、降解及翻译等代谢过程。m6A修饰蛋白或者m6A结合蛋白的表达异常或m6A 修饰水平异常,可导致m6A 修饰相关RNA 代谢的异常,影响基因的表达,与很多疾病发生发展有密切关系,m6A成为了近年来的研究热点,很多国自然或者博士课题都想搭上该热点。
当前高分文章发表及国家自然基金支持情况均反映表观及RNA甲基化,尤其是m6A已成为当前学术研究的热点方向,是一个增长迅速、拥有巨大研究意义的新兴领域。鉴于表观/RNA甲基化具有重要的临床研究意义,我们特别邀请到在该领域拥有丰富经验的专家老师为大家详细的介绍表观/RNA甲基化的研究内容、研究方向及课题思路,并通过培训使学员熟练的掌握甲基化相关课题的数据获得和分析过程,迅速成为表观遗传领域的主力军。
基础的m6A机制研究,如:
m6A与外泌体结合:
m6A与非编码RNA结合
m6A与自噬
肿瘤干性、侵袭转移相关
【会议目标】
由多年从事表观遗传与RNA甲基化的科研人员授课,通过深入浅出的理论讲解和实例案例,帮助学员拓展研究思路,提升科研水平,增加职业竞争力。通过本次课程培训将使学员系统掌握当前主流的表观遗传与RNA甲基化分析流程、方法和软件,国自然课题设计思路,从零基础实现到CNS图表的绘制,同时提升研究深度和广度,拓宽研究思路。
【授课专家】
来自中科院,长期从事表观遗传学多组学方面的项目研究,发表Nature等杂志四十多篇论文。目前承担国家科技部、国家自然基金委和重点研发计划等多项课题。
【主要内容】(详细内容参见日程)
1、RNA甲基化功能机制、研究策略及思路分析
2、RNA甲基化测序和数据分析
3、RNA甲基化多组学整合分析思路及课题设计
4、利用公共数据库和多组学数据进行甲基化课题设计及基金申请
【授课方式】
1、理论结合实操;
2、案例讲解分析结合;
3、协助分析学员的实际数据
RNA甲基化(m6A)数据分析与课题设计会议日程 |
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日期 |
时间 |
大纲 |
详细内容 |
周六上午(理论) |
8:30-10:30 |
RNA甲基化功能机制 |
1.RNA甲基化研究概述 |
2.RNA甲基化类型、特征、生成和作用机制 |
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3.RNA甲基化对RNA加工代谢的调控 |
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4.RNA甲基化调控多种生物学功能的作用机理 |
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10:45-12:00 |
RNA甲基化研究策略及思路分析 |
1.RNA甲基化在疾病等领域中的研究应用 |
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2.通过高分文献解读并总结RNA甲基化调控肿瘤研究思路 |
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12:00-13:30 |
午餐及午休 |
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周六下午(理论+实操) |
13:30-15:30 |
RNA甲基化测序和数据分析(一) |
1.RNA甲基化研究技术路线概览。 |
2.RNA甲基化常用的各种测序技术 |
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3.m6A甲基化的研究思路和分析内容 |
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4.m6A测序技术流程介绍及测序报告解读 |
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15:45-18:00 |
RNA甲基化测序和数据分析(二) |
5.m6A甲基化测序的项目延伸及思路拓展 |
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6.m6A peak鉴定(R包exomePeak、MACS2)、peak差异分析 (R包exomePeak)、motif分析(Homer、MEME)及peak分布(RMBase)等 |
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周日上午(理论) |
8:30-10:30
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RNA甲基化多组学整合分析思路及课题设计(一) |
1.RNA甲基化与RNA甲基化蛋白功能网络研究 |
2.整合多组学探索RNA甲基化的功能和机制 |
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3.RNA甲基化与RNA-seq、Ribosome profiling等数据整合分析 |
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10:45-12:00
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RNA甲基化多组学整合分析思路及课题设计(二) |
4.非编码RNA(miRNA、circRNA及lncRNA等)的RNA甲基化分析思路 |
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5.RNA甲基化研究策略、课题设计与经验交流 |
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6.RNA甲基化相关国自然课题介绍 |
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12:00-13:30 |
午餐及午休 |
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周日下午(理论+实操) |
13:30-15:30 |
利用公共数据库和多组学数据进行甲基化课题设计及基金申请(一) |
1.通过TCGA,GEPIA,ENCORI等数据库挖掘RNA甲基化癌症研究思路 |
2.通过RNA甲基化常用数据库(RMBase,m6AVar,MeT-DB,whistle)等明确关键基因的修饰位点 |
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3.预测RNA甲基化位点在线工具介绍 |
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4.RNA甲基化修饰基因功能富集分析(DAVID,Metascape等) |
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15:45-17:30 |
利用公共数据库和多组学数据进行甲基化课题设计及基金申请(二) |
5.RNA甲基化研究常见图形绘制:分布趋势图,饼图,热图,韦恩图,火山图,散点图,GO、KEGG富集图,网络图,累积曲线图,GSEA图等 |
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6.RNA甲基化基金申请写作思路、准备内容及方案设计注意事项等 |
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7.讨论及个性化问题答疑 |
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备注 |
上课使用软件为R和Rstudio |
会议时间:2021年7月3-4日
会议地点:线上:腾讯会议网络会议室
线上:北京金泰绿洲酒店 北京市东城区永外彭庄甲58号
酒店推荐:高级房 480元/天,普通房 360元/天 此价格需通过主办方预定
主办方:上海遐永医药科技有限公司
收费标准:线上:2800元/人;线下面授:3200元/人
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