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2019测序与芯片的高通量数据挖掘与分析学习班(4月上海班)

2019测序与芯片的高通量数据挖掘与分析学习班(4月上海班)

2019-04-03 08:00 至 2019-04-04 18:00

上海   上海中兴和泰酒店

上海遐永医药科技   医药加科研培训中心   上海遐锦生物科技有限公司   

报名截止

推荐会议:2025第十三届国际基因节

发票类型:增值税普通发票 增值税专用发票

-会议内容-

课程背景介绍

高通量数据挖掘与分析是基于生信的方法从芯片及测序高通量数据中挖掘到与研究方向最相关的靶标基因(mRNA,miRNA,lncRNA或蛋白)。随着高通量手段的不断进步,测序和芯片的成本也逐渐降低,速度也越来越快,使用高通量手段(测序/芯片)进行科研的优点非常明显,也是大势所趋! 


做过测序或者芯片实验的科研人员越来越多,虽然测序公司已经给出了一部分的数据分析,比如过滤、质控比对、定量和差异等,但是这些分析属于基础傻瓜式的标准分析,并不能完整的讲一个故事!我们也很难在大量的差异基因中筛选获得关键基因。因此,需要我们自己掌握高通量数据挖掘的能力,从海量信息中获得自己想要的关键基因!


培训目的:

很多学员都做过测序或者芯片实验,虽然测序公司已经给出了一部分的数据分析,比如过滤、质控、比对、定量和差异等,但是这些分析属于基础傻瓜式的标准分析,并不能完整的讲一个故事!因此,需要我们自己掌握高通量数据挖掘的能力,从海量信息中获得自己想要的关键基因!


培训预期:

通过2天的培训(半天理论课程+1天半实践操作),使学员掌握生信文献分析思路和8个实用操作知识点,可以独立完成一篇基于公共数据库的高通量数据挖掘分析。


通过该主题的学习,可以学会:

高通量公共数据的详细信息查找/下载

在线做差异表达分析

在线blast分析

基因ID转换

通路map图制作

功能富集分析

蛋白互作分析

网络图的构建和美化

-主办方介绍-

上海遐永医药科技

南京巴傲得生物科技有限公司(Biogottechnology,co,Ltd),是专一服务于生命科学研究的专业技术型企业。是一大批志同道合的资深专业人士共同创办的具有现代化经营管理水平的生物高科技企业,从事生物技术产品的开发及销售,致力于将巴傲得生物打造成中国乃至世界一流的生物技术产品供应商。巴傲得生物长期备有Bioworld抗体现货4000多种抗体可以在一周左右送到客户的手里。精湛品质、合理价格、专业服务,是我们为您服务的宗旨。在细胞信号通路、免疫学、蛋白组学上拥有显著优势,其抗体产品、生长因子等为生命科学科研工作者提供了极大的便利。

医药加科研培训中心 医药加科研培训中心

举办了2018肠道菌群与代谢组学国自然课题设计及研究策略专题会议(12月北京班) 2019临床预测模型构建与基于R语言统计分析学习班(01.05-01.06北京班) 2019全国循证医学Meta分析及网状Meta三天精讲学习班(1月北京班) 第10期测序与芯片高通量数据挖掘与分析学习班2019(1月上海班) 2019肠道菌群与代谢组学国自然课题设计及研究策略专题会议(1月上海班) 2019国自然基金标书构思与撰写学习班(1月上海班) TCGA,GEO生信高通量数据挖掘专题学习班2019(1月上海班) 第8期医学SCI论文写作及发表技巧学习班2019(1月上海班) ......

上海遐锦生物科技有限公司 上海遐锦生物科技有限公司

上海遐锦生物科技有限公司于2019年11月29日举办全国循证医学Meta分析与网状Meta研讨会2019(11月上海班)会议。

课程安排

1、理论课程:第一天上午

8.30-10:00第一节:基因数据库使用介绍

测序标准报告的解读

NCBI Gene数据库:最权威的基因综合数据库之一

NCBI GEO数据库: 数据量最大的高通量公共数据库

GEO2R工具:在线做差异分析的R工具

bioDBnet:在线基因ID转换工具

Uniprot: 最权威的蛋白综合数据库之一


10.15-12:00第二节: DAVID工具——功能富集分析

功能富集的原理和意义

基因ID转换

基因功能注释(GO ,KEGG pathway)

基因功能富集(GO ,KEGG pathway)

基因功能聚类(GO ,KEGG pathway)


2、实践操作课程(共1天半)

第一天下午

13:30-17:30第三节  聚类热图及pathway map图

KEGG 数据库:最权威的通路数据库(pathway map 分析)

HEMI软件:构建聚类热图的本地软件


第二天上午

8:30-10:00第四节  STRING工具——基因/蛋白相互作用分析(PPI)

蛋白互作分析的原理和意义

单个蛋白的蛋白互作分析

多个蛋白的蛋白互作分析

STRING工具的使用步骤:输入、参数设置、输出等


10:15-12:00第五节 cytoscape网络做图软件(上)

网络图构建

逐个修改节点的属性和修改边的属性

网络展示方式layout更美观

网络统计分析


第二天下午

13:30-15:30第六节  cytoscape网络做图软件(下)

批量修改节点的属性和修改边的属性

Cytoscape的常用插件:ClusterONE

Cytoscape的常用插件:BinGO

15:30-17:00  答疑环节

2019测序与芯片的高通量数据挖掘与分析学习班(4月上海班)

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2019测序与芯片的高通量数据挖掘与分析学习班(4月上海班)

讲师简介

宋伟博士

成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。


研究方向:有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。


培训经历:在上海、沈阳、济南、武汉等城市举办过十几场培训班。培训的对象有:医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。


培训方向:《测序与芯片数据分析》、《生物信息学的魅力》、《生信文章实例解读》、《生信与实验的密切关系》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《多组学整合分析流程》、《R语言培训》等。

-会议门票-

学习费用

两天班2800元/人,注册费包含会场、教材、专家讲课费,一小时串联视频等费用,不含住宿费


优惠政策:

1.提前确认报名及转账的,可以提前拿到学习材料与发票

2.三人组团报名,每人优惠100元

3.四人组团报名,每人优惠200元

4.五人组团报名缴费,额外带一人免费注册! 

5.参加过本学习班TCGA/GEO数据挖掘的学员可以享受半价优惠。


可以开正规会务发票,纸质邀请函(盖红章)。​​​​​​​

注意事项:携带windows系统的电脑,苹果电脑请务必提前做好双系统。现场不得录音录像。


住宿安排

住宿:不强行规定,可自己预订附近其他酒店,费用自理。如需预定,可与工作人员联系。


培训地点

北京市东城区永外彭庄甲58号(南二环陶然桥西南侧)金泰绿洲酒店

-场馆介绍-

上海中兴和泰酒店 上海中兴和泰酒店

交通指南:

浦东张江地区

驾车距离2.7公里(约6分钟)

浦东国际机场

驾车距离25.8公里(约33分钟)

虹桥国际机场

驾车距离30.5公里(约46分钟)

虹桥火车站

驾车距离32.0公里(约53分钟)

上海火车站

驾车距离18.0公里(约29分钟)

市中心

驾车距离15.0公里(约24分钟)

世纪公园

驾车距离6.6公里(约12分钟)

龙美术馆

驾车距离3.9公里(约7分钟)

上海中兴和泰酒店位于浦东张江高科技园区的核心地带,附近有地铁二号线张江高科站,毗邻新国际博览中心、磁悬浮车站,距离迪士尼度假区20分钟车程左右;周边生活设施齐全,有集餐饮、KTV、电影院等休闲娱乐为一体的综合性休闲广场。
  
酒店占地面积一万多平方米,属园林景观式酒店,拥有精心装修的各式客房,环境优雅、舒适,特设园林景观房、湖景套房。同时酒店全面覆盖WIFI,让你随时随地享受网上冲浪的乐趣。
  
店内有中、西餐厅、商务中心、大堂吧、10个中小型会议室、健身房、乒乓球室和SPA馆,装修温馨舒适、服务贴心细致,让你流连忘返。

会议标签:

数据库 DAVID cytoscape 基因 STRING

温馨提示
酒店与住宿: 异地参会客户请注意,为防止会议临时变动,建议您先与活动家客服确认参会信息,再安排出行与住宿事宜。
退款规则: 活动各项资源需提前采购,购票后不支持退款,可以换人参加。

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