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通过新一代测序技术，测定16S rRNA等标签序列，是微生物生态学研究革命性的技术进步，目前已经迅速发展成为微生物组学相关研究的主流手段。其中，由于Illumnia测序的成本优势，使用越来越广泛；如何对高通量测序序列进行处理和计算，是相关技术的核心，也是传统微生物学研究团队用好该技术的瓶颈问题。去年学会及学员反应热烈，应微生物生态专委会要求，特开展第二期高通量测序数据分析培训班。今年结合16S rRNA测序QIIME分析，以及GeoChip芯片分析两大重要工具。继续邀请了QIIME开发者Rob Knight实验室开发团队核心成员和周宏伟教授及其团队主讲Illumnia测序数据分析及QIIME高级脚本的应用。同时，微生物群落研究已经从组成转到功能，功能基因芯片（GeoChip）技术也得到广泛应用，但其中的探针设计原理及数据解析仍为该技术应用的难题。将特邀GeoChip开发者周集中教授本人及团队核心成员为芯片部分培训主讲人。
第二届微生物生态与海洋环境论坛及培训班定于2014年10月17-22日在宁波举行。本次培训班宗旨是：（1）理解分析流程中采用相关步骤的科学背景；（2）学会并实际操作以QIIME为代表的微生物群落分析工具；（3）学会基因芯片数据分析的流程和注释。
高通量测序和基因芯片技术费用高、风险大，其实验设计的科学性及严谨性就显得特别重要，因此，我们邀请了周集中教授和其他著名微生物生态学和生物信息学专家就微生物生态学中科学问题凝练、实验设计及数据分析等问题做主题报告和研讨。
参会对象：以微生物生态学领域科研骨干和在读博士研究生为主要培训对象，优先吸收已有微生物生态学在研项目的科研人员。
时间地点
会议时间：2014年10月16～22日
会议地址：宁波大酒店（论坛部分）；宁波大学图书馆机房（数据分析培训部分）。
组织机构
主办方：中国生态学学会微生物生态专业委员会、宁波市科协
承办方：宁波大学、宁波市海洋与水产学会
协办方：中国科学院生态环境研究中心
10月16日 报到
10月17日 论坛1天
10月18～22日 生物信息学数据分析培训5天。（邓晔，周宏伟，徐振江主讲, 盛华芳，何彦，熊金波和王凯现场咨询）
培训内容：
功能基因芯片设计原理数据分析流程
功能芯片的实例应用
高通量测序分析微生物生态的进展史与关键点
序列的处理与质控、拼接
嵌合体序列去除与UCHIME的使用
OTU聚类（UCLUST，TSC等工具的使用）
Alpha多样性分析（多样性指数，Chao，Shannon，PD，以及Coverage）
序列系统分类（RDP, GAST）
OTU表格，热图，及相关统计分析
UniFrac原理
Beta多样性分析
PCoA与Biplot
QIIME完整流程的自动化运行
实验操作与数据分析对结果的影响
Sitepainter（备选）
LEfSe
生态统计学
周集中 教授，本次培训首席专家，俄克拉荷马大学，“计划”入选者，功能基因芯片（GeoChip）发明者，获“美国总统青年科学家”奖
周宏伟 教授，南方医科大学，“优青”获得者
杨云峰 教授, 清华大学环境学院
邓晔 研究员，中国科学院生态环境研究中心，“百人计划”获得者
徐振江 博士， Rob Knight实验室（QIIME开发团队）
专题报告会不收取参会费；培训班3200元/人。食宿统一安排，费用自理。
1、免费活动如何报名参加？
请通过文章中的联系方式报名参加。
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你可以在网站上留言或电话(400-003-3879)咨询，我们会尽快联系你。
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2014-10-16 00:00 至 2014-10-22 00:00
