【胃肠道疾病/肿瘤研究】——对实验设计、分析和方法提出了更高要求
直播将解析以下文章思路与实验设计：
案例预告
· 研究内容：幽门螺旋杆菌感染对胃肠道微生物影响研究——基于山东省临朐县胃癌高发区的一项人群研究
· 发表时间：2019
· 发表期刊：Gut(IF:17)
实验设计思路图
Guo, Yang, et al. "Effect of Helicobacter pylori on gastrointestinal microbiota: a population-based study in Linqu, a high-risk area of gastric cancer." Gut (2019).
文章亮点评述
1.取样地点选取山东省临朐县，首先当地居民饮食结构上保持因素单一，其次该县为胃癌高发地，具有很高的研究意义；
2.同时采集粪便与胃粘膜样本进行相互对比，更贴合疾病类型，以得出新颖结论；
3.研究分析逻辑清晰，结果明确。
胃肠道疾病/肿瘤疾病研究方向进展与趋势
① 疾病关系研究趋势
a. 样本类型是关键，贴合实验目的，不同样本相互验证
b. 关联已不足以说明问题，正向因果关系探究转变
c. 测序方法升级宏基因组，多组学/临床指标要齐加入
② 疾病Biomarker筛找研究趋势
a. 实验规模再提升，纯数据分析更是如此
b. Biomarker寻找从菌属到菌种再到菌株
c. 菌种+基因功能+代谢产物，多组学marker分辨率更高
③ 疾病治疗研究趋势
a. 病人持续跟踪记录很有必要
b. 疾病研究最终要落到标志物上
c. 多因素/多指标研究成主流
④ 宿主关联研究趋势
a. 前沿方向，高分洼地
b. 人+菌双重分析，更好阐述疾病机制
c. 对生信提出高要求
【精神类疾病研究】——高分洼地，疾病关系研究仍是主流
直播将解析以下文章思路与实验设计
案例预告
· 研究内容：肠道微生物组有效鉴别重性抑郁障碍（MDD）和双相情感障碍（BD）
· 发表时间：2019
· 发表期刊：Advanced Science(IF:15.8)
实验设计思路图
Yachida, Shinichi, et al. "Metagenomic and metabolomic analyses reveal distinct stage-specific phenotypes of the gut microbiota in colorectal cancer." Nature medicine 25.6 (2019): 968-976.
文章亮点评述
1.创意新颖，先前研究少，且为临床真实需求，有重要意义；
2.前期大量样本挑选出疾病标志物后，有验证及样本完善实验设计。
疾病研究方向进展与趋势
① 疾病关系研究趋势
a. 疾病关系仍是精神类疾病研究主流，依然可发高分期刊
b. 多组学/指标联合分析崭露头角，尤其是神经递质检测
② 疾病Biomarker筛找研究趋势
a. 虽和胃肠道研究不在一个级别，但实验规模依然有待提升
b. 病人持续跟踪十分必要
c. 细分/特色类疾病类型深挖，可有奇效
d. 有待多组学biomarker共同分析
③ 疾病治疗研究趋势
a. 相关研究相对较少，机会尚存
b. 治疗方式待深入，实验设计待完善
④ 宿主关联分析研究
a. 相关研究较少，机会尚存
【慢病(心血管疾病、糖尿病)研究】——机制初探明，下步做突破
直播将解析以下文章思路与实验设计
案例预告
· 研究内容：高血压患者的肠道微生物和短链脂肪酸特征研究
· 发表时间：2020
· 发表期刊：Scientific Reports(IF:4.2)
实验设计思路图
Calderón-Pérez, Lorena, et al. "Gut metagenomic and short chain fatty acids signature in hypertension: a cross-sectional study." Scientific Reports 10.1 (2020): 1-16.
文章亮点评述
1.多样的取样类型和研究方法，相互关联验证，结果丰富；
2.探究粪便与血浆中短链脂肪酸差异，印证先前推测；
3.生信分析逻辑清晰明确。
疾病研究方向进展与趋势
① 疾病关系研究趋势
a. 疾病与肠道微生物关系初探明，尤其在心血管疾病领域
b. 因果关系研究是必然
c. 多组学/指标联合分析成为发表高分文章的必然
② 疾病Biomarker筛找研究趋势
a. 高分文章已经对实验规模提出了更高要求
b. 代谢组学已经凸显出重要意义，重磅文章频出
③ 疾病治疗研究趋势
a. 用药、手术、饮食等治疗方法与慢病息息相关，研究待深入
b. 特色疾病类型或成突破口
c. 治疗方式待深入，实验设计待完善
④ 宿主关联分析研究
a. 相关研究较少，机会尚存
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