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会议详情 |
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三天教学内容：
1. 获得比较扎实的 R 语言基础；
2. 能够用 R 语言进行数据分析；
3. 能够使用 ggplot2 绘制常见图形；
4. 掌握 PCA、共表达、聚类、Heatmap、富集、Cytoscape 等分析；
5. 掌握 GEO、TCGA 数据库数据的下载、挖掘。
适合人群
推荐医学研究者和学生；
零基础学员参
作为大型医院来说，科研成果是非常重要的参与综合考量的指标。而作为一名临床医师，不管愿意不愿意，都要一边忙繁忙的临床工作，一边应付复杂的医患关系，还要挤出时间兼顾医学科研。一天二十四小时，医生恨不得过成二十五小时：
临床医生科研本就薄弱，做实验攒数据劳心劳力。
梦想升主治医师，评职称拿基金全要拼 SCI 文章？
好不容易得到测序数据，聚类分析，富集分析还是不会做？
想用 R 语言分析基因芯片和 TCGA 数据，但是不知道如何入手？
想做高水平的科学数据分析图，但是连个热图都画不出来？
不论是为了评职称，为了毕业，还是为了提高文章质量而希望学习 R 语言的朋友们，这次有福了！
丁香园携手张旭东老师专为医学生及生信零基础的初学者量身打造线下培训课程《R 语言与数据表达培训班》，从安装软件到差异表达分析、火山图富集分析、生存分析、Cytoscape 网络图绘图、GEO 与 TCGA 数据挖掘、ggplot2 绘图等，手把手教学，不懂就问，再也不因为找不到 bug 抓耳挠腮了。
与其三天打鱼两天晒网地用零碎时间学习，不仅吃力且效率低下，还不如好好利用三天时间向专业的老师系统地学习，一口气吃透 R 语言！
是不是很心动？还有更心动的：
心动一
干货满满 全方位配套内容
首先，本次课程不仅仅是一次线下课程，你还将得到非常贴心的配套内容：
赠送相关生物信息教材
赠送 14 门以上视频课程
赠送自动化脚本、流程和测试数据
赠送高性能服务器，免费用一整年
赠送必备生物信息软件、数据库
加入 VIP 交流答疑群
也就是说普通的三天线下培训怎么够，真正的内容不止三天！
课前视频教学（预习）+现场实操练习（动手）+课后问题交流（复习）
虽然三天很难从小白一下子变成 R 语言高手，可是在这里，你能迈开第一步，不会担心装不上各种软件，不会看不懂公司反馈的分析图，给自己信心，才是成为高手的第一步。
心动二
专为医学生和零基础者设计
经过上次培训的经验总结，生物学霸和张老师决定为医学生或相关专业设计 R 语言课程，学完本次课程，你将收获：
1. 比较扎实的 R 语言基础；
2. 能够用 R 语言进行数据分析；
3. 能够使用 ggplot2 绘制常见图形；
4. 掌握 PCA、共表达、聚类、Heatmap、富集、Cytoscape 等分析；
5. 掌握 GEO、TCGA 数据库数据的下载、挖掘；
6. 了解其他领域的方法在医学领域中的推广；
丁香园
丁香园成立于2000年7月23日，一直致力于医药及生命科学领域的互联网实践，是目前行业规模最大， 并极具影响力的社会化媒体平台。丁香园用户超过400万，我们为用户提供多种形式的交流平台和工具， 我们的产品和服务帮助专业用户提高生产力；我们服务的客户达数千家，并分布在全球各地，我们提供针对专业用户的精准数字化营销等服务。 丁香园正尝试将服务的范围扩展到大健康领域，利用我们的优质医疗资源，结合互联网和移动互联网的手段为大众健康服务。
会议安排
第一天 9:00～12:00
R 语言基础
1. R语言介绍
2. 快速入门：通过一个例子，30分钟理解编程语言的体系框架
3. 环境部署：R、Rstudio、包的安装
4. 数据类型：数值型、字符型、逻辑型
5. 数据结构：向量、数据框、列表、因子等
6. 流程控制：循环、条件
7. 输入输出
第一天 14:00～18:00
表达数据挖掘原理
1. 表达芯片与转录组测序原理
2. 表达数据挖掘思路串讲，锁定关键基因与锁定关键样本有哪些方法？
3. 差异表达与假设检验，更多生物学重复还是更多数据量？
4. 富集分析，多种富集分析方法，GSEA等？
5. 相关性分析，生物学重复好不好？如何提取表达模式相似的基因？
6. 主成分分析，降低数据维度，简化分析
7. 聚类分析？搞清楚样本关系，将功能相似的基因聚成模块
8. WGCNA：探索模块与性状的关系，肿瘤分期如何作为性状？
9.有哪些其他领域的研究方法可以推广到医学研究中？
第二天 9:00～12:00
表达数据挖掘实操
1. 差异表达分析及火山图绘制
2. 富集分析及图表绘制
3. 相关性分析及绘图
4. 聚类分析与绘图
5. Heatmap 绘图，各种复杂的热图绘制
第二天 14:00～18:00
表达数据挖掘实操
1. 主成分分析与绘图
2. WGCNA，加权共表达分析与绘图
3. Cytoscape 网络图绘图
4. 富集分析，GSEA
5. 生存分析会绘图
第三天 9:00～12:00
GEO 与 TCGA 数据挖掘
1. SRA 数据库介绍
2. GEO 数据库介绍及数据下载和整理
3. TCGA 肿瘤数据库介绍及数据下载和整理
4. GEO、TCGA 分析流程和代码参数讲解（赠送全套流程代码）
第三天 14:00～18:00
Tidyverse：数据处理与ggplot2绘图
1. Ti bble 数据结构介绍，与数据框的转换
2. 使用 tidyr 进行数据变形
3. 使用 dplyr 进行数据处理和统计
4. ggplot2 基本概念：图层、映射、标度、几何对象、统计变换、主题、坐标
5. 绘图实战：散点图、条形图、直方图、箱线图、小提琴图、密度图等
6. 图形美化：主题设置
7. 实用技巧：分面、一页多图等
华大基因一线工程师，学员好评如潮
张旭东老师：CNS 一作、一线工程师、基因课创始人
曾任华大基因项目组组长、产品研发组组长，自 2017 年起，专注生物信息学培训，累计学员 3000 余人。
发表文章：麻疯树基因组计划（the plant journal）、鹰嘴豆基因组计划（Nature Biotechnology）、 芝麻基因组计划（Genome Biology）、猕猴桃群体研究（New Phytologist）。
培训经历：已完成 14 门视频课程的开发，在武汉、成都、西安、杭州、广州、北京等地举办快速入门班11期、周末成长班 2 期。培训对象包括医生、学生、科研工作者以及生信爱好者等。
王莹老师：曾任华大基因、贝纳基因高级生物信息工程师
九年生物信息从业经验，擅长基因组拼接、比较基因组和进化分析。
发表文章：甲藻基因组（Science）、穿心莲基因组（The Plant Journal）、野生大豆基因组（Nature Communications）、菊花基因组（Molecular Plant）、鹰嘴豆基因组计划（Nature Biotechnology）、 芝麻基因组计划（Genome Biology）、猕猴桃群体研究（New Phytologist）。
用户好评
张老师的培训课程已经顺利开展了 13 期，给学员们提供一个系统的入门途径，加上张老师随和耐心的讲解，收获了学员一致好评。
| 票种名称 | 价格 | 原价 | 票价说明 |
| 会务费 | ¥3600 | ¥ | 只包含学习费用，食宿交通费自理 |
| 3人及以上团购 | ¥3300 | ¥3600 | 只包含学习费用，食宿交通费自理 |
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