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会议详情 |
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2019-12-21 09:00 至 2019-12-22 18:00
50人
推荐会议：2024（第七届） 世界细胞治疗与再生医学大会暨展览会
发票类型：增值税专用发票 增值税普通发票
参会凭证：邮件/短信发送参会通知 电子票
随着高通量组学技术的蓬勃发展，生物医学已进入大数据时代。借助生物医学多组学、多层次的海量数据，可以从前所未有的广度和深度来研究生物体运行机制，但海量复杂数据带来的挑战同样巨大。由于生物医学数据多呈分散复杂特征，因此常需要深入分析已有数据。在此基础上，以海量数据发掘与解析为主体内容的生物信息学实践技能就成为科研必要手段，如疾病的病因学、临床诊断标志物、作用靶点识别，关键大分子的发现与功能预测，以及遗传调控机制等方面。授课着力于以实际问题为引线，将理论授课与上机实践有机地融为一体，逐步介绍涉及的各项技能，并指导学员将其融会贯通以真正掌握相关的基本方法与常用工具。主讲专家从事本科、研究生教学多年并在二十余期培训会议中取得了极高的教学评价，受到广大学员的一致好评和推崇。会议有关事宜通知如下：
时间地点：
2019年12月21日-22日（周六-周日） 上海田林宾馆
授课方式：
1. 上机操作
2. 专题小组研讨与案例讲解分析结合
3. 课后答疑
注意事项
1. 上机实践需自带笔记本电脑（非上网本），会场将布置充足的电源插座。
2. 电脑操作系统为Win7/8/10专业版（非任何商业版及Mac系统），办公软件为Office 2007以上专业版（非任何商业版及WPS Office），否则无法保证软件顺利安装和使用。
3. 授课幻灯、软件（附安装指南）及上机实践文档已上传至百度网盘，在报到通知中会告知链接及密码。软件请事先下载并安装，如安装有问题，请咨询客服或开课当天到会场咨询。
4. 严格按照培训日程授课（共计22标准学时），第二天下午16:00结课，方便外地学员返程。
【主办单位】
玮瑜科研平台（上海玮瑜生物科技有限公司）
【承办单位】
上海玮瑜生物科技有限公司
【时间地点】
时间：
上海：2019年12月21-22日 20日报到，上海田林宾馆
玮瑜科研平台（上海玮瑜生物科技有限公司）
玮瑜科研平台（上海玮瑜生物科技有限公司）于2019年12月28日举办2019转录组测序数据分析及案例实践培训班（12月上海班）。
课程大纲（全部课程均含上机实践）：
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12月21日 |
08:00-08:30 |
软件安装 |
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08:30-10:30 |
核酸信息注释 |
l NCBI数据库：Gene（参考序列）、Nucleotide（非参考序列）子数据库。 l EBI数据库：HGNC（标准全称/缩写识别、转换）、Expression Atlas（表达图谱）子数据库。 l 基因结构数据库：内含子剪切位点、启动子序列及分析策略、转录因子及其结合位点。 |
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10:30-12:00 |
蛋白质信息注释 |
l 蛋白质序列数据库：UniProt数据库。 l 蛋白质相互作用数据库：String数据库。 l 蛋白质三级结构数据库：PDB数据库。 l 功能注释数据库：GO、KEGG数据库。 |
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14:00-17:30 |
非编码RNA信息注释及靶点分析 |
l 非编码RNA注释、靶点预测、验证靶点、功能及疾病关联等数据库。 1. miRNA：miRBase、TargetScan、miRTarBase、miRPath、miRDB等。 2. lncRNA：NONCODE、LNCipedia、lncRNAdb、LncBase等。 3. circRNA：circBase、starBase、CircInteractome等。 |
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19:00-22:00 |
表达数据挖掘与聚类 |
l 利用GEO2R在线工具筛选获得差异表达基因集，并获得TCGA数据库交集结果。 l 利用ArrayTools软件处理GEO数据库下载的表达谱数据。 l 表达谱数据聚类分析。 |
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12月22日 |
08:30-12:00 |
基因集差异共表达分析 |
l 基因集差异共表达分析策略。 l 利用DAVID在线工具进行基因集功能富集分析（GO MF、BP、CC；KEGG Pathway）。 l 绘制基因集功能富集图/维恩图。 l 基因集相互作用图形化分析。 |
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13:30-16:00 |
交互作用数据可视化 |
l 利用Cytoscape软件进行关联基因注释、分子间相互作用、基因集差异表达、基因集共表达的可视化。 l 可视化结果的保存与输出。 |
【住宿说明】
学员也可以自行预定，不做强求
田林宾馆380或450元/标间
【注册费用】
3600元/人。授课期间发放纸质邀请函（盖章）和发票。按交费先后顺序确定座位号。会务期间提供午餐，晚餐自理。
上海田林宾馆隶属上海市人民政府机关事务管理局，是一所综合服务设施较为完备的三星级宾馆，坐落在沪西幽雅静谧的田林新村，毗邻上海高技术工业区和徐家汇商业中心。交通便利，乘166,732,830,712,93,946,89,120路公交车均可到达，新建的地铁9号线 会议标签：
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