会议详情 |
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R语言数据分析实战技术(网络)研讨会
腾讯会议网络会议室 2021年6月5-6日
会议简介:
众所周知,可以用来做生信分析及作图的数据库database、在线工具web-service、软件software有很多,其中R软件是一种适应性最广、上手最快的工具。本次学习通过手把手教学让学员掌握R软件下载安装、Rstudio用法、常用医学统计学算法模型R实现、R语言常用作图、R语言数据处理方法与编程技术、掌握R语言自主学习实践的方法与技巧,现场解答学员在实际工作中遇到的有关技术问题,让学员更好地掌握相关技术的应用。另外,课后学员有感兴趣的图片,老师也可以提供相应的R代码。
本次会议同样适合R语言零基础学员,因为R软件做分析及作图,都有比较现成的R包及代码。比如转录组分析相关的R包及代码,可以用来做差异分析、火山图、热图、PCA图、WGCNA等。比如单细胞测序数据分析相关的R包及代码,可以用来做细胞分型及聚类。还有RNA甲基化分析相关的、蛋白组代谢组相关的、临床统计分析相关的R包及代码。以一个做热图的代码为例子,虽然每个人的数据是不同的,但是只要拿到了做热图的代码,我们就可以只是简单的修改其中几个参数,就可以轻松作出热图!我们只需要记住那几个关键参数的含义及修改即可,而且,代码中还有详细的中文注释!
总体思路是根据生信相关的SCI文章为主题,完成里面所有的分析内容。该培训适用于对生信分析或者医学统计学分析感兴趣,编程零基础及以上的学员参加。
上海遐锦生物科技有限公司于2019年11月29日举办全国循证医学Meta分析与网状Meta研讨会2019(11月上海班)会议。
课程 |
主 要 内容 |
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第一天 上午 |
R语言——编程环境、数据结构、语法和练习 |
R软件的历史、简介、优缺点 |
R编程形式与资源 |
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R软件的安装 |
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Rstudio使用技巧及安装 |
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R语言的数据结构 |
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R语言的编程方法 |
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一起练——R语言的编程练习 |
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第一天 下午 |
生信参考文献解读 |
生信文献的流程解读 |
常用的生信分析流程 |
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流程模块使用的R包及函数简介 |
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案例展示 |
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常用R函数 |
统计编程思想与流程 |
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数据描述性分析R实现 |
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统计分析R实现 |
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实战操作演练——卡方检验、回归分析、方差分析、Fisher精确检验、相关性分析等 |
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第一天 晚上 |
常用R包(1) |
R包的安装 |
芯片数据预处理——标准化,归一化 |
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差异分析——计算差异倍数,T检验,火山图 |
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聚类分析——PCA分析,热图分析 |
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第二天上午 |
常用R 包(2) |
R语言功能富集分析,功能条形图,功能气泡图 |
共表达分析——pearson法,相关性散点图 |
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生存预后分析——KM曲线图,添加p值,HR值 |
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实操 |
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第二天下午 |
常用R包(3) |
单细胞测序相关分析 |
RNA甲基化相关分析 |
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时间序列分析——多组连续样本的基因表达聚类 |
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实操 |
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R语言学习的方法与技巧 |
算法思想、R包及函数用法、参数说明、范例程序 |
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如何找到有用的R资源 |
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R语言学习小窍门 |
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互动环节与答疑 |
专家简介:宋博士
成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。
研究方向:有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。
会议预期:通过该培训,可以学会R语言基础(输入文件格式、输出文件格式、操作代码的参数调整)、统计学上各种算法的实现、SCI常用图片生成
PS:必须携带电脑,最好是win10系统,苹果系统需自己安装好R和Rtudio软件。会后主办方会统一提供全程录像作为复习资料。
会务费用:3000元
优惠政策:
1. 提前报名并付款的,可以预先拿到学习资料
2. 三人组团报名,每人优惠100元
开具正规会务费发票,提供纸质盖章邀请函
时间:2021年6月5-6日(2天一夜)
5日 白天 9:00-17:30,晚上 19:00-22:00
6日 白天 9:00-17:30
地点:腾讯会议网络会议室
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